More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0313 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 282 aa  556  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0390953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1363  2-dehydropantoate 2-reductase  81.63 
 
 		 283 aa  435  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00078431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1786  2-dehydropantoate 2-reductase  47.86 
 
 		 278 aa  279  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.43842 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2003  2-dehydropantoate 2-reductase  54.09 
 
 		 280 aa  276  3e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  55.32 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  34.88 
 
 		 309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  42.23 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  38.49 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  35.16 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  31.51 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  30.98 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  33.79 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  31.21 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.2 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  32.3 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  31.48 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 343 aa  95.9  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  27.81 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  32.27 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 327 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  35.92 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  43.33 
 
 		 296 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  31.29 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  28.85 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  30.95 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  30.14 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.95 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  40.62 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  32.65 
 
 		 345 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 		 301 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  35.11 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  29 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  36.71 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  41.73 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  27.7 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  30.69 
 
 		 307 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  30.16 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  29.78 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  29.81 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  28.34 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  26.95 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  26.86 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  29.33 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.82 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  42.37 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.01 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  23.67 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  26.58 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  35 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  29 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  37.8 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  41.86 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  30.54 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  27.46 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  29.37 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.8 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  36.62 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  26.78 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  27.74 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  30.57 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  26.96 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  30.25 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>