64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3598 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  100 
 
 
530 aa  1088    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  32.21 
 
 
556 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  33.27 
 
 
533 aa  249  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  25.12 
 
 
630 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  24.63 
 
 
571 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  34.35 
 
 
588 aa  77.4  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  26.28 
 
 
478 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  26.89 
 
 
976 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  27.68 
 
 
601 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  31.78 
 
 
519 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  24.78 
 
 
506 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  25.93 
 
 
452 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  27.12 
 
 
461 aa  54.3  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  23.61 
 
 
709 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  25.74 
 
 
430 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  31.68 
 
 
455 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  20.69 
 
 
427 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3031  hypothetical protein  44.23 
 
 
70 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  24.11 
 
 
509 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  29.76 
 
 
437 aa  50.4  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  23.12 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  26.9 
 
 
540 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  31.51 
 
 
457 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  25.31 
 
 
619 aa  48.9  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  28.24 
 
 
176 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  24.04 
 
 
203 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  38.89 
 
 
451 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  28.28 
 
 
598 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0344  hypothetical protein  28.81 
 
 
378 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  24.91 
 
 
428 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  24.43 
 
 
532 aa  47  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  23.6 
 
 
444 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4456  hypothetical protein  28.46 
 
 
616 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.756747  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  25.95 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  28.16 
 
 
769 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  60.98 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  30.12 
 
 
452 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  31.82 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1153  recombination protein F  27.45 
 
 
357 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.409843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  29.81 
 
 
427 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  24.48 
 
 
464 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  28.57 
 
 
497 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  21.64 
 
 
584 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  45.65 
 
 
544 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  44.9 
 
 
543 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  31.52 
 
 
442 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  23.91 
 
 
251 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  33.33 
 
 
623 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  29.86 
 
 
228 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.09 
 
 
647 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  37.35 
 
 
482 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0896  hypothetical protein  36.84 
 
 
672 aa  44.3  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.693496  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  24.53 
 
 
736 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  22.73 
 
 
440 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  29.9 
 
 
923 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  36.73 
 
 
544 aa  43.9  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1141  ABC transporter related  30.51 
 
 
303 aa  43.9  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.27 
 
 
652 aa  43.5  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  31.03 
 
 
606 aa  43.5  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  28.33 
 
 
461 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  29.92 
 
 
410 aa  43.5  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  33.78 
 
 
357 aa  43.5  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  27.03 
 
 
597 aa  43.5  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  31.87 
 
 
582 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>