More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0268 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
363 aa  695    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  80.51 
 
 
373 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  50.42 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  47.22 
 
 
362 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  43.17 
 
 
379 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  45.11 
 
 
409 aa  279  5e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  43.59 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  51 
 
 
357 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  53.61 
 
 
363 aa  262  8.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  46 
 
 
352 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  45.35 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  45.35 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  35.69 
 
 
349 aa  189  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  35.67 
 
 
398 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  35.94 
 
 
406 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  35.94 
 
 
406 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  37.07 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  35.89 
 
 
350 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  31.53 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  33.91 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  32.07 
 
 
368 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  31.23 
 
 
360 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  36.06 
 
 
405 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  32.09 
 
 
359 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  31.23 
 
 
360 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  31.61 
 
 
356 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  34.15 
 
 
373 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  32.65 
 
 
364 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  32.36 
 
 
372 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  35.67 
 
 
398 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  33.23 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  31.3 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  33.53 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  34.74 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  36.14 
 
 
350 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  36.14 
 
 
349 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  37.07 
 
 
354 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  33.64 
 
 
348 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  34.11 
 
 
371 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  35.89 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  33.33 
 
 
349 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  34.4 
 
 
371 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  33.23 
 
 
372 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  31.98 
 
 
380 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  33.43 
 
 
353 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  35.83 
 
 
362 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  32.46 
 
 
360 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  34.7 
 
 
382 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  32.14 
 
 
358 aa  153  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  34.93 
 
 
364 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  34.43 
 
 
360 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  32.66 
 
 
356 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  30.7 
 
 
356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  30.7 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  30.7 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  35.91 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  30.7 
 
 
356 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  30.7 
 
 
356 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  30.7 
 
 
356 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  30.7 
 
 
356 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  31.71 
 
 
356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  35.29 
 
 
355 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  32.09 
 
 
356 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  32.75 
 
 
360 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  28.53 
 
 
361 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  34.43 
 
 
356 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  33.63 
 
 
356 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  33.23 
 
 
359 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  31.63 
 
 
351 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  33.91 
 
 
363 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  32.63 
 
 
359 aa  142  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  30.88 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  31.82 
 
 
359 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  33.24 
 
 
370 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  32.46 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  30.09 
 
 
391 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  32.2 
 
 
387 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 
381 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  29.86 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  29.86 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  29.86 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  29.86 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  29.86 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  29.86 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  29.86 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  29.86 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  28.92 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  28.92 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  29.22 
 
 
365 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  33.33 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  32.67 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  30.54 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  32.46 
 
 
366 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  32.1 
 
 
369 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 
360 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 
365 aa  122  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  29.52 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>