194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1891 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1891  NUDIX hydrolase  100 
 
 
179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0590  NUDIX hydrolase  45.35 
 
 
181 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.04 
 
 
216 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.9 
 
 
216 aa  111  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  33.51 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1287  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
196 aa  93.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1568  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
246 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2083  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  26.78 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  28.16 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  27.32 
 
 
207 aa  64.3  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  24.14 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  25.97 
 
 
211 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 
227 aa  62  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  30.56 
 
 
199 aa  61.6  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  25.15 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  24.71 
 
 
227 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  24.71 
 
 
226 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  25.29 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  25.97 
 
 
199 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  26.14 
 
 
171 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 
199 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 
197 aa  58.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 
199 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  26.7 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 
210 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  25.68 
 
 
199 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1964  MutT/nudix family protein  30.99 
 
 
163 aa  57.8  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  25.58 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  25 
 
 
199 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  24.57 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  24.86 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  24.16 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  24.29 
 
 
245 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  26.29 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  24.7 
 
 
211 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
241 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  28.16 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  25.68 
 
 
235 aa  55.5  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  26.86 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  24.56 
 
 
216 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93596  predicted protein  24.72 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00324294  hitchhiker  0.00263062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  22.94 
 
 
200 aa  54.3  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  28.16 
 
 
199 aa  54.3  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  24.71 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  25.68 
 
 
199 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  23.67 
 
 
198 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  23.46 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  28.25 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  24.18 
 
 
235 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  21.56 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  23.53 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  23.16 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  29.38 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  22.35 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  23.03 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  27.53 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  25.41 
 
 
227 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  24.29 
 
 
200 aa  52  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  27.43 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  28 
 
 
189 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 
216 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  25.7 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  25.7 
 
 
234 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  23.89 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1470  hypothetical protein  28.57 
 
 
191 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  27.16 
 
 
221 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  25.7 
 
 
234 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  23.89 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  22.6 
 
 
198 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  24.42 
 
 
195 aa  51.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  23.86 
 
 
177 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 
221 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  21.23 
 
 
244 aa  51.2  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  22.6 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_6789  predicted protein  30.33 
 
 
132 aa  51.2  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  22.22 
 
 
223 aa  50.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  24.43 
 
 
233 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  22.54 
 
 
214 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  22.35 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  23.86 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1513  hypothetical protein  29.45 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  21.39 
 
 
225 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  22.49 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  27.19 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  24.18 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  23.64 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  24.42 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1805  NUDIX hydrolase  24.44 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000497318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 
221 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  23.2 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>