More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0602 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0602  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0474  ABC transporter related  64.2 
 
 		 243 aa  344  7e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1376  ABC transporter related  54.85 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000264902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1310  ABC transporter related  54.43 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18110  ABC transporter related  45.89 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3458  ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.572348  normal  0.0203751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1181  ABC transporter related  41.96 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0796  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0810  ABC transporter related  42.33 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0897  ABC transporter related protein  43.11 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3013  ABC transporter related  37.87 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0529408  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1216  ABC transporter related  37.83 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000901825  normal  0.0692557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1561  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0664  ABC transporter ATP-binding protein  32.19 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  36 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1165  ABC transporter related  31.5 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0385  FeS assembly ATPase SufC  38.24 
 
 		 258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.686208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0671  hypothetical protein  32.02 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1969  FeS assembly ATPase SufC  37.5 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1078  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0141  ABC transporter, ATP-binding protein  32.16 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.772366  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0516  FeS assembly ATPase SufC  33.76 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2553  FeS assembly ATPase SufC  37.12 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0319  ABC transporter related  32.22 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1640  FeS assembly ATPase SufC  33.19 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.020441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0171  FeS assembly ATPase SufC  31.72 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1530  ABC transporter related  31.67 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.429665  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1905  FeS assembly ATPase SufC  33.78 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.421706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0815  FeS assembly ATPase SufC, putative  32.49 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5398  FeS assembly ATPase SufC  32.02 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21920  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  37.25 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0536  ABC transporter related  32.05 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0735  ABC transporter related  32.49 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000763972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2608  ABC transporter related  31.82 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000140749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  33.64 
 
 		 321 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11510  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.1 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.012943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1345  FeS assembly ATPase SufC  32.64 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  hitchhiker  0.0000000997935 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09991  ABC transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.198968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2337  FeS assembly ATPase SufC  38.22 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3283  FeS assembly ATPase SufC  33.33 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429528  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16150  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  33.33 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1086  ABC transporter related  36.82 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.48609  normal  0.328712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1371  ABC transporter related  36.11 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_719  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly ATPase component  32.49 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2227  FeS assembly ATPase SufC  32.92 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000208508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5151  FeS assembly ATPase SufC  37.25 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2023  FeS assembly ATPase SufC  31.22 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.213724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1234  FeS assembly ATPase SufC  31.38 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2266  FeS assembly ATPase SufC  38.05 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1848  FeS assembly ATPase SufC  36.1 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000939138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2452  ABC transporter related  31.91 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.471668  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1143  FeS assembly ATPase SufC  36.76 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26780  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  31.62 
 
 		 270 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0218  ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1674  FeS assembly ATPase SufC  35.29 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.305783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3080  FeS assembly ATPase SufC  32.61 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190526  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_002950  PG0258  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1236  FeS assembly ATPase SufC  32.49 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1007  FeS assembly ATPase SufC  31.03 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.515464 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  33.92 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0416  ABC transporter related  31.56 
 
 		 248 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04455  ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.730062  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2106  FeS assembly ATPase SufC  35.61 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.118871  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  32.75 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0488  ABC transporter related  32.26 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2917  FeS assembly ATPase SufC  33.2 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749779  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2438  FeS assembly ATPase SufC  34.6 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2483  FeS assembly ATPase SufC  34.6 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2474  FeS assembly ATPase SufC  34.6 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4346  FeS assembly ATPase SufC  29.54 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5984  ABC transporter  37.31 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1461  FeS assembly ATPase SufC  32.75 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3978  FeS assembly ATPase SufC  29.54 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3307  FeS assembly ATPase SufC  32.61 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000620228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1415  FeS assembly ATPase SufC  33.18 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2332  FeS assembly ATPase SufC  33.89 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000811964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3152  FeS assembly ATPase SufC  29.96 
 
 		 253 aa  121  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0929379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4458  FeS assembly ATPase SufC  30.25 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1467  FeS assembly ATPase SufC  31.82 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0406739  normal  0.0473468 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2254  FeS assembly ATPase SufC  32.23 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0419  ABC transporter related  31.58 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0696  FeS assembly ATPase SufC  32.07 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.0776058 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2389  FeS assembly ATPase SufC  28.87 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2271  FeS assembly ATPase SufC  33.05 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193787  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1415  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  32.64 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.901133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1182  FeS assembly ATPase SufC  33.65 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  32.89 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  32.78 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2507  FeS assembly ATPase SufC  34.3 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1503  ABC transporter related  31.58 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0206703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0785  FeS assembly ATPase SufC  34.31 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00319351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03031  ABC transporter, ATP binding component  30.38 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.471612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2735  FeS assembly ATPase SufC  34.15 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33754 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0496  FeS assembly ATPase SufC  31.42 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.496286  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0304  FeS assembly ATPase SufC  33.95 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.553044  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2960  FeS assembly ATPase SufC  35.64 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13370  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  36.32 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1658  FeS assembly ATPase SufC  32.44 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14650  Iron-regulated ABC transporter ATPase subunit SufC  35.79 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>