135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0136 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
1307 aa  2611    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.75 
 
 
1534 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.43 
 
 
1534 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.67 
 
 
1352 aa  436  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.01 
 
 
1704 aa  210  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  24.77 
 
 
1559 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  19.94 
 
 
1737 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.58 
 
 
2195 aa  142  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.9 
 
 
2191 aa  141  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.98 
 
 
1821 aa  140  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.8 
 
 
1872 aa  122  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.56 
 
 
2002 aa  115  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.49 
 
 
2002 aa  112  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  20.71 
 
 
1521 aa  108  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  21.66 
 
 
1516 aa  102  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  20.94 
 
 
1516 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.22 
 
 
2125 aa  95.9  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.48 
 
 
1823 aa  92  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  27 
 
 
1835 aa  90.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.54 
 
 
1594 aa  90.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  24.32 
 
 
1582 aa  87.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.31 
 
 
1916 aa  86.7  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.79 
 
 
1594 aa  86.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.4 
 
 
2057 aa  84.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  24.75 
 
 
1665 aa  84.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.41 
 
 
1664 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  25.17 
 
 
1805 aa  82.4  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  25.89 
 
 
1652 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.04 
 
 
1824 aa  80.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  25.76 
 
 
1649 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  20.04 
 
 
1759 aa  79  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.88 
 
 
1768 aa  79  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  23.99 
 
 
1906 aa  78.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.63 
 
 
1663 aa  78.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.34 
 
 
1833 aa  77.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.84 
 
 
1869 aa  76.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.94 
 
 
1927 aa  75.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.06 
 
 
1819 aa  75.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  24.84 
 
 
1727 aa  75.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  21.36 
 
 
1807 aa  75.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  22.14 
 
 
1925 aa  74.3  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.68 
 
 
1697 aa  73.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.35 
 
 
1628 aa  73.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  24.4 
 
 
1808 aa  72.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.4 
 
 
1808 aa  72.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.53 
 
 
1635 aa  72.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  19.16 
 
 
1974 aa  72  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.86 
 
 
1632 aa  72  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.71 
 
 
1971 aa  71.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  25.7 
 
 
1803 aa  71.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  20.24 
 
 
1403 aa  71.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  21.89 
 
 
1815 aa  71.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.35 
 
 
1971 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.53 
 
 
1832 aa  71.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.15 
 
 
1633 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.34 
 
 
1682 aa  70.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.47 
 
 
1808 aa  70.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  19.61 
 
 
1953 aa  69.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.7 
 
 
1633 aa  68.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.7 
 
 
1633 aa  68.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.77 
 
 
1596 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  22.59 
 
 
1739 aa  68.6  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  23.33 
 
 
1921 aa  67.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.39 
 
 
1859 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  23.78 
 
 
1921 aa  67.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.12 
 
 
1765 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.89 
 
 
1641 aa  67  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  21.38 
 
 
1737 aa  66.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  21.83 
 
 
1738 aa  65.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  22.8 
 
 
1839 aa  65.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.2 
 
 
1782 aa  65.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  22.06 
 
 
1603 aa  65.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  23.43 
 
 
1637 aa  64.3  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21 
 
 
1823 aa  64.3  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.02 
 
 
1768 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  21.73 
 
 
1478 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  21.55 
 
 
1504 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  20.9 
 
 
1737 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  23.43 
 
 
1874 aa  63.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  21.55 
 
 
1504 aa  63.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.55 
 
 
1758 aa  63.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.6 
 
 
1785 aa  63.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  21.55 
 
 
1504 aa  63.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  22.22 
 
 
1411 aa  63.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  21.14 
 
 
1534 aa  62.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  21.14 
 
 
1534 aa  62.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2191  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.06 
 
 
1854 aa  62.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466531  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.14 
 
 
1504 aa  62.8  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  22.15 
 
 
1743 aa  62.4  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  24.2 
 
 
1641 aa  62  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.69 
 
 
1772 aa  62  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.95 
 
 
1737 aa  62  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  22.95 
 
 
1644 aa  62  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.77 
 
 
1864 aa  61.6  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.69 
 
 
1772 aa  61.6  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1529  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.8 
 
 
1895 aa  61.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.753642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  30.48 
 
 
1737 aa  60.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 
1979 aa  60.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  22.6 
 
 
1646 aa  60.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  22.26 
 
 
1644 aa  59.7  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>