More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0248 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
149 aa  286  9e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  53.38 
 
 
149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  50.68 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  43.62 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  42.57 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
211 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  44.97 
 
 
149 aa  116  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
291 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  41.61 
 
 
150 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  35.57 
 
 
153 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  36.91 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.37 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  39.19 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
149 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  37.86 
 
 
140 aa  92  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  36.81 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  38.1 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  39.29 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  38.89 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  39.16 
 
 
141 aa  84.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  38.57 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  41.78 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  31.62 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.82 
 
 
478 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  31.25 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  36.36 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.2 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  30.2 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  36.17 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  34.03 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.03 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.71 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.48 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
605 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.01 
 
 
188 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  37.3 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  30 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.56 
 
 
664 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  33.33 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  31.21 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  35.54 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  39.42 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  37.19 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  31.01 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  31.58 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  23.08 
 
 
189 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  32.82 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  41.33 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 
629 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  33.05 
 
 
188 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  27.13 
 
 
207 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  29.92 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  35.34 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  31.4 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0262  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
314 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1763  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 
200 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  30.43 
 
 
188 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.61 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2051  putative signal transduction protein with CBS domains  33.59 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  26.12 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  32.52 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  31.4 
 
 
589 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  31.85 
 
 
221 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  30.65 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  36 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  32 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  35.45 
 
 
213 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.58 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  33.63 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  30.99 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  31.4 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.71 
 
 
485 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  33.04 
 
 
666 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 
1344 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  31.54 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.34 
 
 
606 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  28.24 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  31.62 
 
 
640 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.75 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  31.53 
 
 
615 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  38.2 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  33.33 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
1274 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
204 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>