157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2552 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  100 
 
 		 336 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  68.6 
 
 		 334 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  52.74 
 
 		 348 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  49.39 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  48.31 
 
 		 337 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  45.09 
 
 		 435 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  42.59 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  46.6 
 
 		 334 aa  222  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  40.3 
 
 		 424 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  39.4 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  37.73 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  39.02 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  40.49 
 
 		 362 aa  196  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  38.49 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  39.26 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  37.35 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.29 
 
 		 371 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  35.2 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  32.25 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  34.81 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  34.31 
 
 		 404 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.41 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  35.91 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  32.42 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  30.61 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  27.84 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  26.45 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  27.05 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  34.04 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  34.06 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  31.93 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.37 
 
 		 643 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.4 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  37.93 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  30.06 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  35.43 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.58 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  31.45 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.61 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27.16 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  27.17 
 
 		 460 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  27.7 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  30.87 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.57 
 
 		 1087 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  31.51 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  29.48 
 
 		 1046 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.37 
 
 		 577 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  23.47 
 
 		 1207 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.43 
 
 		 1055 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  28.47 
 
 		 536 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.97 
 
 		 1048 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  22.28 
 
 		 591 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.89 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 647 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 		 1065 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.66 
 
 		 723 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  30.43 
 
 		 518 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  35.45 
 
 		 603 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 642 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  26.13 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 		 295 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 		 468 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  33.79 
 
 		 1198 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  24.88 
 
 		 435 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.35 
 
 		 622 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  29.01 
 
 		 518 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.1 
 
 		 611 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.09 
 
 		 622 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 		 1027 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  26.37 
 
 		 1209 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 		 1027 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  29.73 
 
 		 1358 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 		 1027 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  29.41 
 
 		 553 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  27.08 
 
 		 684 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25 
 
 		 431 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.35 
 
 		 631 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  27.84 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 		 546 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.21 
 
 		 596 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 597 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>