More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2437 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 653 aa  1305    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  57.75 
 
 		 575 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  47.37 
 
 		 422 aa  363  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  47.7 
 
 		 420 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  47.38 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  47.83 
 
 		 420 aa  359  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  44.31 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  45.21 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  43.2 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  45.85 
 
 		 442 aa  326  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  43.86 
 
 		 450 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  41.75 
 
 		 1270 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  46.83 
 
 		 426 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  44.54 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  44.15 
 
 		 416 aa  300  8e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  46.19 
 
 		 420 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  40.34 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  43.81 
 
 		 419 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  43.37 
 
 		 422 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  43.37 
 
 		 422 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  44.79 
 
 		 421 aa  294  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  43.13 
 
 		 422 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  40.54 
 
 		 417 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  45.37 
 
 		 437 aa  289  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  44.77 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  39.9 
 
 		 438 aa  277  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  43.46 
 
 		 405 aa  277  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  38.44 
 
 		 441 aa  276  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  38.63 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  43.03 
 
 		 437 aa  273  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  40.67 
 
 		 437 aa  273  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  39.04 
 
 		 446 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  43.52 
 
 		 427 aa  270  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  36.82 
 
 		 438 aa  269  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  38.81 
 
 		 445 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  38.97 
 
 		 419 aa  261  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  35.8 
 
 		 410 aa  261  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  38.46 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  37.69 
 
 		 444 aa  251  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  34.54 
 
 		 471 aa  251  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  38.53 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  35.68 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  34.78 
 
 		 470 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  38.17 
 
 		 453 aa  244  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  39.42 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  39.4 
 
 		 389 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  40.36 
 
 		 387 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  39.59 
 
 		 389 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  40.48 
 
 		 387 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  37.91 
 
 		 389 aa  204  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  39.29 
 
 		 387 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  39.88 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.29 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  39.29 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  39.88 
 
 		 387 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  35.99 
 
 		 403 aa  200  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  39.88 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  35.51 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  36.53 
 
 		 399 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  38.97 
 
 		 394 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  38.79 
 
 		 394 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  41.61 
 
 		 406 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  33.82 
 
 		 465 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  33.82 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.23 
 
 		 438 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 		 396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  38.3 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  40.36 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  38.3 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  38.3 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  37.09 
 
 		 379 aa  191  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  37.72 
 
 		 396 aa  191  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  37.43 
 
 		 396 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  37.43 
 
 		 396 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  37.43 
 
 		 396 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  37.43 
 
 		 396 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  37.43 
 
 		 396 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  37.43 
 
 		 396 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  40.48 
 
 		 389 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.43 
 
 		 396 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  35.08 
 
 		 388 aa  190  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  37.93 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  33.99 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  42.86 
 
 		 398 aa  188  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  42.14 
 
 		 399 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  42.07 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  37.99 
 
 		 388 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  42.65 
 
 		 389 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  37 
 
 		 390 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  38.05 
 
 		 395 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  41.3 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  36.9 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  38.51 
 
 		 396 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  38.51 
 
 		 399 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  38.51 
 
 		 399 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  39.88 
 
 		 373 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  34.72 
 
 		 388 aa  185  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  31.07 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  32.76 
 
 		 435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>