More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1846 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 416 aa  823    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.09 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  60.53 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.18 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  53.75 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  44.21 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.76 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.4 
 
 		 469 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  45.98 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  44.07 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  40 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  42.95 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  36.78 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  35.14 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  39 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1985  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  40.83 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.46 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  38.41 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.32 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  38.44 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  43.67 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 373 aa  162  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  43.01 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25050  signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  39.46 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.89 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  44.26 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  43.98 
 
 		 393 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  37.8 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.19 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  36 
 
 		 399 aa  156  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 386 aa  154  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.92 
 
 		 478 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  41.51 
 
 		 421 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.24 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  41.09 
 
 		 388 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.31 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4996  histidine kinase  45.39 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  40.54 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 536 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  41.98 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  37.17 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  41.5 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  41.67 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  41.85 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  38.87 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  39.13 
 
 		 410 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  35.9 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  41.83 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  43.98 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.95 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  36.72 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.32 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  37.34 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.9 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.57 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  39.23 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  38.46 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  34.55 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7657  histidine kinase  47.21 
 
 		 434 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.32 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.66 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  33.24 
 
 		 384 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.55 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.15 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  43.15 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.84 
 
 		 430 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  39.44 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.96 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.66 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  42.32 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1124  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  38.76 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  41.87 
 
 		 443 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 403 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0760  histidine kinase  36.46 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  40.51 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  38.89 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  40.09 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>