196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0746 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1064    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  62.35 
 
 		 561 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  52.23 
 
 		 517 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  49.9 
 
 		 524 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  38.71 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  39.49 
 
 		 557 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  36.02 
 
 		 572 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  35.82 
 
 		 567 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0786  peptidase S15  34.63 
 
 		 562 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  35.82 
 
 		 572 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 		 572 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  54.24 
 
 		 218 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4797  peptidase S15  26.69 
 
 		 494 aa  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  27.08 
 
 		 897 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  33.15 
 
 		 876 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  35.54 
 
 		 868 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.94 
 
 		 866 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  29.75 
 
 		 814 aa  79.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27540  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  24.84 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  34.97 
 
 		 1010 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2664  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.95 
 
 		 574 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1460  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  24.78 
 
 		 607 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2891  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  24.06 
 
 		 597 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.024928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  24.3 
 
 		 674 aa  68.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1067  peptidase S15  24.32 
 
 		 775 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2588  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.83 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2618  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.41 
 
 		 579 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2908  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.08 
 
 		 597 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2667  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.31 
 
 		 597 aa  67  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.300273  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2860  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.31 
 
 		 597 aa  67  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2865  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.31 
 
 		 597 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3908  Xaa-Pro dipeptidyl-peptidase  26.67 
 
 		 667 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135659  normal  0.218311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  25 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  29.2 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  31.54 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2873  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.2 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.77 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04392  hypothetical protein  40.74 
 
 		 109 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  22.58 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  23.7 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  22.63 
 
 		 668 aa  63.9  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  30.83 
 
 		 968 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.64 
 
 		 944 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  33.06 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  24.77 
 
 		 778 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  34.95 
 
 		 854 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  32.37 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.06 
 
 		 678 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  30.72 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  22.69 
 
 		 612 aa  60.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  34.81 
 
 		 976 aa  60.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  24.7 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5192  peptidase S15  37.62 
 
 		 813 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.36 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  31.34 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  23 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  25.62 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  33.06 
 
 		 298 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 		 591 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  30.82 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 588 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  21.11 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  30.6 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  23.82 
 
 		 679 aa  56.2  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  35.34 
 
 		 317 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  21.19 
 
 		 286 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  27.32 
 
 		 345 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  30.67 
 
 		 318 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4258  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.34 
 
 		 812 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.575828  normal  0.163799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  32 
 
 		 467 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  30.66 
 
 		 292 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  27.44 
 
 		 287 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  33.06 
 
 		 299 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  28.57 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 295 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  27.01 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  29.17 
 
 		 384 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  21.07 
 
 		 615 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  24.23 
 
 		 677 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  26.56 
 
 		 250 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.09 
 
 		 545 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5229  peptidase S15  33.33 
 
 		 806 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.649793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.87 
 
 		 629 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.75 
 
 		 604 aa  51.6  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.75 
 
 		 667 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  26.58 
 
 		 887 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  24.6 
 
 		 626 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.6 
 
 		 626 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.16 
 
 		 645 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.18 
 
 		 580 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  29.48 
 
 		 534 aa  50.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  29.5 
 
 		 306 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.36 
 
 		 634 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.53 
 
 		 561 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.19 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 305 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  33.98 
 
 		 304 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  25 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  30.43 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>