57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0005 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  347  5e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  51.32 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  67.35 
 
 		 117 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  54.29 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  51.54 
 
 		 206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  41.89 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  47.92 
 
 		 217 aa  94.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  37.18 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  37.18 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  37.18 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.2 
 
 		 196 aa  92  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  43.05 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  43.93 
 
 		 188 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  33.15 
 
 		 188 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  35.37 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  43.62 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  40.2 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  37.38 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  43.93 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  36.45 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  31.43 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  43.62 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  38.18 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  30.92 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  39.36 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  42.31 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  37.84 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  39.36 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  34.87 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  40.86 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  33.1 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  38.3 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  34.07 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.43 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  32.98 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  40.43 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  37.38 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  26.53 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  30.67 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2421  hypothetical protein  31.37 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.464043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  29.49 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  28.95 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0587  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.683361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  31.25 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  26.88 
 
 		 105 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  22.35 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  27.66 
 
 		 97 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  27.14 
 
 		 101 aa  41.6  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  27.14 
 
 		 101 aa  41.2  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  28.57 
 
 		 286 aa  40.8  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  30.51 
 
 		 97 aa  40.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0498  hypothetical protein  34.78 
 
 		 119 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>