More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3992 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
226 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.56 
 
 
227 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.76 
 
 
228 aa  278  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.85 
 
 
246 aa  275  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0902023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.98 
 
 
236 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2308  short chain dehydrogenase  45.33 
 
 
235 aa  205  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3017  short chain dehydrogenase  45.29 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.493678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
289 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
252 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
244 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
277 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
244 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
254 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
276 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
257 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 
291 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0250  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.08 
 
 
240 aa  104  9e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.183431  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
277 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
277 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  32.97 
 
 
276 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 
261 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
291 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
249 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
280 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 
277 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
291 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
291 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
276 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.11 
 
 
246 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
245 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
237 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
277 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
285 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.43 
 
 
249 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
248 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
291 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
258 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0999  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.39 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.72 
 
 
246 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
293 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.72 
 
 
246 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 
276 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.05 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 
243 aa  99  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
293 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
269 aa  99  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
285 aa  98.6  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
282 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2477  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2891  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.45 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000353377  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2790  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570924  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0532  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1800  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2905  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.901799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.29 
 
 
258 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2523  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  27.97 
 
 
248 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 
248 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219217  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 
277 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2851  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2964  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  27.97 
 
 
248 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  hitchhiker  0.0000180421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.1 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.66 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
240 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.39 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  33.16 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1287  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.6 
 
 
252 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.69 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.68 
 
 
244 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.79 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1421  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.48 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0474  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.4 
 
 
254 aa  95.9  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  30.15 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.7 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.86 
 
 
246 aa  95.5  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
251 aa  95.5  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
306 aa  95.1  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
279 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
279 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.64 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
276 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.8 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000401343  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.18 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>