228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1646 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 
135 aa  270  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  76.87 
 
 
135 aa  220  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  79.1 
 
 
135 aa  218  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  73.13 
 
 
142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  68.89 
 
 
155 aa  192  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  65.93 
 
 
134 aa  186  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  69.4 
 
 
135 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  64.44 
 
 
151 aa  179  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  63.7 
 
 
134 aa  179  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  59.7 
 
 
140 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  69.63 
 
 
135 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  70.59 
 
 
136 aa  172  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  71.11 
 
 
134 aa  164  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  71.43 
 
 
133 aa  164  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  73.85 
 
 
129 aa  159  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  59.26 
 
 
133 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  60.9 
 
 
133 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  60.9 
 
 
133 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  60.9 
 
 
133 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  56.2 
 
 
136 aa  149  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  59.35 
 
 
129 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  55.81 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  58.54 
 
 
129 aa  141  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  48.12 
 
 
136 aa  140  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  37.23 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  40.3 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  36.15 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  34.09 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  39.39 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  32 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  39.83 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  34.75 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  34.56 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  33.6 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  38.24 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  37.4 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  38.41 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  40.17 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  32.2 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  33.09 
 
 
131 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  33.06 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  29.58 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  36.67 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  32.26 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  38.46 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  31.71 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  32.37 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  36.03 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  32.2 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  34.33 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  31.71 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  30.3 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  31.58 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  31.82 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  35.77 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  27.78 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  30.09 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  31.88 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  26.92 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  32.33 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  34.86 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  32.33 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  32.58 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  32.84 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  34.17 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  32.84 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  41.84 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  34.07 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  31.58 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  33.63 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  42.42 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  35.83 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  27.97 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  35.11 
 
 
160 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  34.35 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  30.83 
 
 
155 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  37.1 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  30.65 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  27.07 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  25.37 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  27.13 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  34.69 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  25.58 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  30.47 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  28.7 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  30.08 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  32.31 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  32.03 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  24.81 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  33.59 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  32.17 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  29.82 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  34.81 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>