More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1202 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1202  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
519 aa  1058    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.868764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
723 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621858  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  28.25 
 
 
719 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2519  histidine kinase  28.92 
 
 
728 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
722 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2451  histidine kinase  30.43 
 
 
722 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0542472  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
722 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152137  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
725 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355217  normal  0.132598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  29.89 
 
 
719 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
719 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2192  sensor histidine kinase  29.46 
 
 
687 aa  171  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
722 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
719 aa  170  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
719 aa  170  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1015  sensor histidine kinase  32.55 
 
 
690 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
723 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
738 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33918  normal  0.73238 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03558  putative sensor histidine kinase  26.65 
 
 
722 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3919  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
750 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3686  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
678 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3981  sensor histidine kinase  27.65 
 
 
738 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 
540 aa  98.2  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 
525 aa  97.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 
529 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
564 aa  94.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 
589 aa  93.6  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  24.44 
 
 
481 aa  93.2  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  23.48 
 
 
607 aa  92.8  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  24.5 
 
 
475 aa  91.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  27.2 
 
 
477 aa  90.5  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  27.2 
 
 
477 aa  90.5  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  27.13 
 
 
472 aa  89.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 
501 aa  89  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  24.29 
 
 
590 aa  87.8  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 
596 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 
578 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
611 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  24.71 
 
 
449 aa  84  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 
577 aa  84  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  25.18 
 
 
596 aa  83.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 
574 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  25.21 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  23.15 
 
 
343 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  24.79 
 
 
483 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  25.89 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 
550 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
607 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 
810 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  23.75 
 
 
589 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.68 
 
 
770 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 
549 aa  81.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
559 aa  81.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 
605 aa  81.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.95 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
745 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  26.61 
 
 
481 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  24.24 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  24.24 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.25 
 
 
768 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  24.24 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  26.72 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
566 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  23.22 
 
 
601 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 
605 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.64 
 
 
745 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.13 
 
 
781 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  24.22 
 
 
745 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.5 
 
 
768 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.5 
 
 
768 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1893  histidine kinase  24.68 
 
 
545 aa  77  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00596145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 
835 aa  77  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  24.08 
 
 
480 aa  77  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 
599 aa  77  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  23.35 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.62 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
462 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.76 
 
 
616 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
563 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.54 
 
 
581 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.5 
 
 
768 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  23.93 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  26.25 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  23.67 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  22.44 
 
 
616 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 
934 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  22.44 
 
 
616 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 
602 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  24.91 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
701 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>