More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0534 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 308 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  76.07 
 
 		 306 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  74.75 
 
 		 307 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  74.43 
 
 		 307 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  71.1 
 
 		 309 aa  487  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  72.94 
 
 		 306 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  72.61 
 
 		 311 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  73.11 
 
 		 307 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  72.13 
 
 		 307 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  70.03 
 
 		 309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  69.51 
 
 		 306 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  70.16 
 
 		 307 aa  464  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  69.84 
 
 		 306 aa  461  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  70.26 
 
 		 307 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  69.51 
 
 		 306 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  67.54 
 
 		 306 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  67.87 
 
 		 306 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  64.71 
 
 		 307 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  65.36 
 
 		 307 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  63.73 
 
 		 307 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  63.73 
 
 		 307 aa  433  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  65.36 
 
 		 307 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  65.36 
 
 		 307 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  62.99 
 
 		 312 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  62.34 
 
 		 312 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  65.03 
 
 		 307 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  63.4 
 
 		 307 aa  427  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  62.66 
 
 		 312 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  64.17 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  65.03 
 
 		 307 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  63.4 
 
 		 307 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  62.62 
 
 		 307 aa  424  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  64.92 
 
 		 305 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  61.76 
 
 		 312 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  63.61 
 
 		 306 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  64.38 
 
 		 307 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  62.62 
 
 		 307 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  64.38 
 
 		 307 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  61.49 
 
 		 313 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  60.71 
 
 		 312 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  60.77 
 
 		 317 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  62.26 
 
 		 316 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  62.17 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  60.46 
 
 		 307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  61.97 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  60.66 
 
 		 310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  59.61 
 
 		 313 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  61.15 
 
 		 296 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  57.98 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  54.58 
 
 		 309 aa  363  1e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  54.58 
 
 		 309 aa  363  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  56.62 
 
 		 304 aa  359  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  54.3 
 
 		 307 aa  348  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  55.25 
 
 		 307 aa  347  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  54.92 
 
 		 307 aa  346  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 		 307 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 		 307 aa  341  8e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  54.92 
 
 		 306 aa  338  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  53.36 
 
 		 317 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  53.02 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  52.68 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  52.68 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  52.35 
 
 		 304 aa  328  7e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  51.68 
 
 		 308 aa  328  9e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  51.16 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  52.35 
 
 		 304 aa  326  3e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  51.34 
 
 		 304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  51.68 
 
 		 304 aa  325  6e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  52.84 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  51.17 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  52.19 
 
 		 304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  50.98 
 
 		 308 aa  318  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 		 319 aa  318  6e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  50.65 
 
 		 308 aa  318  7.999999999999999e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  50.34 
 
 		 307 aa  318  9e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 304 aa  318  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  51.83 
 
 		 302 aa  316  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  50.84 
 
 		 309 aa  315  7e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  50.34 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  48.33 
 
 		 311 aa  311  6.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  310  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  310  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 		 318 aa  309  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  49.35 
 
 		 339 aa  308  6.999999999999999e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>