More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3405 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  100 
 
 
357 aa  706    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  66.29 
 
 
356 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  42.71 
 
 
383 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  37.56 
 
 
418 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
660 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  39.31 
 
 
416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 
762 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  40.16 
 
 
435 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 
388 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
669 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 
443 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
388 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  36.05 
 
 
440 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  35.31 
 
 
890 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  34.28 
 
 
678 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
394 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 
808 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
390 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  35.96 
 
 
385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
374 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
388 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
364 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1956  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.85 
 
 
381 aa  113  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.66 
 
 
375 aa  112  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
365 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  37.05 
 
 
390 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28.07 
 
 
490 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  28.07 
 
 
490 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
368 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
386 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
394 aa  96.3  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  36.74 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.13 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
309 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.23 
 
 
496 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.23 
 
 
496 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  26.2 
 
 
513 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
353 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.91 
 
 
502 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  18.34 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.08 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  22.99 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1209  putative glycosyltransferase  30.99 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  27.15 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  21.7 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  31.5 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0081  hypothetical protein  25 
 
 
500 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  25.88 
 
 
743 aa  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.4 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  43.64 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  29.96 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.12 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  32.58 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.38 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>