145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1120 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  78.65 
 
 		 491 aa  657    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  73.87 
 
 		 560 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  74.91 
 
 		 523 aa  751    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 537 aa  1035    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  80 
 
 		 502 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1427  metal dependent phophohydrolase  72.27 
 
 		 588 aa  621  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  71.49 
 
 		 501 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1391  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  61.27 
 
 		 588 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3523  metal dependent phosphohydrolase  66.52 
 
 		 646 aa  565  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.555023  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1221  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  67.04 
 
 		 533 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3992  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  70.67 
 
 		 610 aa  548  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.748921  normal  0.498171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50.84 
 
 		 521 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  53.58 
 
 		 525 aa  505  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  54.72 
 
 		 508 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  52.02 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  54.29 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  51.73 
 
 		 513 aa  497  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  52.76 
 
 		 522 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  52.5 
 
 		 512 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  56.22 
 
 		 513 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  52.32 
 
 		 520 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  52.43 
 
 		 524 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50.4 
 
 		 517 aa  489  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  51.5 
 
 		 487 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  53.51 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  53.51 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  54.12 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  53.16 
 
 		 509 aa  478  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  52.16 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  53.48 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  50.31 
 
 		 520 aa  475  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  54.9 
 
 		 535 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  56.64 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  49.26 
 
 		 521 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  49.26 
 
 		 520 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  48.99 
 
 		 521 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  48.81 
 
 		 520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  48.81 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  48.81 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  48.81 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  48.81 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  51.61 
 
 		 521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  56.55 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  50.85 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  49.26 
 
 		 521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  48.99 
 
 		 520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  56.51 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  51.14 
 
 		 533 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  48.81 
 
 		 520 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  54.44 
 
 		 535 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  50.93 
 
 		 533 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.67 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  52.33 
 
 		 521 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  51.33 
 
 		 521 aa  465  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  56.1 
 
 		 487 aa  463  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  51.84 
 
 		 520 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  47.31 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  48.51 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  51.54 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  51.13 
 
 		 520 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  49.6 
 
 		 519 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  52.85 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  49.4 
 
 		 519 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  56.95 
 
 		 509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.79 
 
 		 530 aa  450  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  50.74 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  49.7 
 
 		 520 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4793  phosphodiesterase  54.9 
 
 		 509 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0108516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  50.2 
 
 		 519 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  48.59 
 
 		 519 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  46.2 
 
 		 519 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  48.46 
 
 		 546 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  51.95 
 
 		 558 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  50 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1425  metal dependent phosphohydrolase  49.6 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.340697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  49.23 
 
 		 516 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  46.54 
 
 		 527 aa  438  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  47.58 
 
 		 519 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  47.05 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  49.01 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2159  phosphodiesterase  47.47 
 
 		 531 aa  432  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  48.35 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  49.11 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  51.63 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  46.62 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  51.83 
 
 		 507 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1608  phosphodiesterase  43.33 
 
 		 527 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.92092  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1490  metal dependent phophohydrolase  43.15 
 
 		 527 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1354  phosphodiesterase  44.2 
 
 		 527 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  48.04 
 
 		 509 aa  421  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  44.24 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  45.24 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1547  metal dependent phosphohydrolase  52.14 
 
 		 512 aa  415  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  45.45 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  49.1 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0306  hypothetical protein  45.49 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.72936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  44.64 
 
 		 536 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  44.54 
 
 		 523 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  48.4 
 
 		 517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>