More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1074 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1074  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 479 aa  927    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2147  putative transcriptional regulator, GntR family  70.22 
 
 		 453 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2010  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.36 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0342  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.54 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00152858  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4267  putative transcriptional regulator, GntR family  52.99 
 
 		 454 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8800  putative transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0636  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2457  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.1171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0751  putative transcriptional regulator, GntR family  45.39 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1139  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.19 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.28 
 
 		 468 aa  312  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3599  putative transcriptional regulator, GntR family  43.46 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 547 aa  203  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  28.17 
 
 		 468 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.38 
 
 		 517 aa  183  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.32 
 
 		 483 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.4 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 470 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.7 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  29.16 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 520 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 470 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 470 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  28.11 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  29.6 
 
 		 474 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  29.6 
 
 		 474 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  29.6 
 
 		 474 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  29.6 
 
 		 474 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  29.6 
 
 		 474 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  29.09 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.09 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  29.09 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  29.09 
 
 		 468 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.24 
 
 		 473 aa  171  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 483 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1523  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 468 aa  170  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1735  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 468 aa  170  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453488  hitchhiker  0.0000000000634797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 481 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  25.89 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 479 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.2 
 
 		 468 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  27.65 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.81 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.81 
 
 		 393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.71 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.06 
 
 		 472 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.41 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  35.08 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 477 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.47 
 
 		 477 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 473 aa  163  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 469 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 393 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  30.31 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  35.08 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.66 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.23 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  26.74 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 497 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  34.55 
 
 		 398 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  33.7 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 477 aa  160  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 469 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  32.88 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 473 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 494 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  25.72 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>