60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0182 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0182  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  100 
 
 		 825 aa  1560    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0395  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  48.1 
 
 		 801 aa  228  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4612  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  49 
 
 		 943 aa  212  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0211251  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0480  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  45.12 
 
 		 1321 aa  200  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1702  sigma-70 region 2 domain-containing protein  45.85 
 
 		 466 aa  189  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6377  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.86 
 
 		 892 aa  187  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0206  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  42.74 
 
 		 1441 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4220  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40 
 
 		 2330 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.184212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6132  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.75 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06010  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  35.09 
 
 		 828 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00830  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  40.95 
 
 		 470 aa  132  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34250  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  34.03 
 
 		 850 aa  111  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.137913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5166  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.32 
 
 		 505 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0248944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0296  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.23 
 
 		 512 aa  110  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166156  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0803  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.07 
 
 		 831 aa  67.8  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08330  hypothetical protein  30.04 
 
 		 263 aa  62  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0824478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  31.08 
 
 		 1129 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1787  RNA polymerase sigma factor  31.06 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0794  sigma-24 (FecI-like)  28.81 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0842  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.46 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  27.57 
 
 		 2485 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0846  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28 
 
 		 292 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  27.16 
 
 		 2490 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33310  hypothetical protein  26.61 
 
 		 318 aa  55.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1461  hypothetical protein  30.15 
 
 		 406 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000257739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  27.16 
 
 		 2490 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.75 
 
 		 2490 aa  56.2  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  27.5 
 
 		 2490 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  26.75 
 
 		 2490 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3459  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.41 
 
 		 196 aa  54.3  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0591092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5221  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.43 
 
 		 529 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6150  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.86 
 
 		 190 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  30.81 
 
 		 3921 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  24.04 
 
 		 676 aa  52  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  29.7 
 
 		 5010 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5681  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  24.21 
 
 		 199 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.232887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1660  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  29.49 
 
 		 174 aa  49.3  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.379101 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  29 
 
 		 5017 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2016  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  30.26 
 
 		 2358 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6609  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.55 
 
 		 180 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  29.5 
 
 		 5017 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0288  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.46 
 
 		 179 aa  47.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  29.5 
 
 		 5017 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  26.12 
 
 		 5017 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3158  RNA polymerase sigma factor  28.42 
 
 		 233 aa  47.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148477  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1000  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.77 
 
 		 205 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000231343  normal  0.0259336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0856  RNA polymerase sigma factor RpoE  25.77 
 
 		 205 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380767  normal  0.0292756 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  30.66 
 
 		 2358 aa  47.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  26.53 
 
 		 5017 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3977  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.38 
 
 		 213 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.186681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0951  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 		 218 aa  46.6  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.941158  normal  0.954881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  28.43 
 
 		 5010 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1381  RNA polymerase sigma-70 factor  23.98 
 
 		 201 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.57599  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2321  RNA polymerase sigma factor RpoE  41.51 
 
 		 199 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  25.31 
 
 		 5010 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  29.5 
 
 		 5010 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5141  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.63 
 
 		 196 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2016  RNA polymerase sigma factor  32.69 
 
 		 181 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4931  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.95 
 
 		 216 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>