182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1843 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  235  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  72.64 
 
 		 118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  38.68 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  42.65 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  37.37 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  32.26 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  32.26 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  32.26 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  32.26 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  32.26 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  32.26 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  34.74 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  43.06 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  34.75 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 113 aa  50.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  36.46 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  33.68 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  33.68 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  29.79 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  32.63 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  31.73 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  31 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  31 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  37.31 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 372 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  32.63 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  37.76 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  31.11 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  29.47 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  28.72 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  39.24 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  34.58 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  30.77 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  34.52 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>