More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0599 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  61.47 
 
 		 618 aa  768    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  66.23 
 
 		 622 aa  850    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 619 aa  1256    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  33.52 
 
 		 540 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.14 
 
 		 538 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 551 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  31.39 
 
 		 533 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 540 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  31.31 
 
 		 546 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 565 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 		 576 aa  233  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 539 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  31.35 
 
 		 563 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 508 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 498 aa  192  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 501 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 509 aa  177  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  28.54 
 
 		 518 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.45 
 
 		 532 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.52 
 
 		 529 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 578 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  26.79 
 
 		 577 aa  163  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.08 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.84 
 
 		 542 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.08 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  24.91 
 
 		 580 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 529 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 524 aa  157  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 577 aa  156  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 516 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  28.46 
 
 		 587 aa  154  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.17 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 607 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.63 
 
 		 607 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.62 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 866 aa  154  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.34 
 
 		 539 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 516 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.59 
 
 		 580 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.59 
 
 		 579 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.16 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  27.56 
 
 		 574 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.54 
 
 		 531 aa  151  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.76 
 
 		 544 aa  150  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 591 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 579 aa  150  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 522 aa  150  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 594 aa  150  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 556 aa  148  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  27.55 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 544 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.19 
 
 		 544 aa  147  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  27.55 
 
 		 495 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.6 
 
 		 532 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 521 aa  146  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.27 
 
 		 531 aa  146  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  29.59 
 
 		 542 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 549 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 553 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  27.16 
 
 		 628 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 		 534 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 578 aa  144  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 631 aa  143  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.3 
 
 		 521 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.69 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.69 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.69 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 526 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 536 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0145  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 552 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 522 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.16 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 572 aa  140  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27.18 
 
 		 527 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  28.04 
 
 		 557 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  27.77 
 
 		 544 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  26.12 
 
 		 518 aa  139  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  25.83 
 
 		 573 aa  138  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  25.43 
 
 		 575 aa  138  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.24 
 
 		 575 aa  138  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.24 
 
 		 575 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 540 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.23 
 
 		 594 aa  137  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 587 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 		 1437 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>