233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2706 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  100 
 
 
625 aa  1279    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  36.8 
 
 
472 aa  248  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.82 
 
 
471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.9 
 
 
476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.67 
 
 
469 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1449  putative transport protein  28.47 
 
 
508 aa  153  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118167  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  28.1 
 
 
527 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2835  putative transport protein  28.23 
 
 
508 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2756  putative transport protein  28.23 
 
 
508 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000301777  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.75 
 
 
460 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  27.78 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.7 
 
 
460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3256  oligogalacturonide transporter  27.25 
 
 
508 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  26.4 
 
 
475 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.23 
 
 
457 aa  147  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
523 aa  144  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3380  oligogalacturonide transporter  27.47 
 
 
519 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0691  oligogalacturonide transporter  28.68 
 
 
508 aa  136  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3542  oligogalacturonide transporter  28.26 
 
 
519 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3365  oligogalacturonide transporter  29.68 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0926  oligogalacturonide transporter  28.43 
 
 
508 aa  134  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0971  oligogalacturonide transporter  29.8 
 
 
525 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  28.32 
 
 
455 aa  120  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  30.47 
 
 
449 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  27.89 
 
 
443 aa  114  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  28.28 
 
 
448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
475 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  29.84 
 
 
448 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  27.23 
 
 
442 aa  108  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.78 
 
 
469 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  26.56 
 
 
453 aa  107  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  25.69 
 
 
480 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  28.27 
 
 
448 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.3 
 
 
448 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.46 
 
 
443 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1744  Na-galactoside symporter  24.7 
 
 
508 aa  100  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  23.37 
 
 
480 aa  100  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.68 
 
 
463 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.11 
 
 
447 aa  96.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.95 
 
 
552 aa  94.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.95 
 
 
552 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.33 
 
 
544 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  25.6 
 
 
451 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  26.4 
 
 
472 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  25.06 
 
 
467 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.08 
 
 
461 aa  90.9  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  23.85 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.14 
 
 
468 aa  90.1  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  28.17 
 
 
465 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  24.56 
 
 
459 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.08 
 
 
441 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.08 
 
 
442 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.71 
 
 
442 aa  87.8  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.81 
 
 
442 aa  87.8  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  29.83 
 
 
479 aa  87  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  26.38 
 
 
468 aa  87  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.76 
 
 
441 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  26.13 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  26.13 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.25 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.74 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  26.13 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  26.13 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  22.22 
 
 
467 aa  84  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.57 
 
 
465 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  23.28 
 
 
497 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.24 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  22.51 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  23.35 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  24.73 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1593  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.87 
 
 
462 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.113599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1675  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.07 
 
 
462 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  24.44 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  26.65 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  25.07 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  24.3 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  24.3 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1391  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.67 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  24.3 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  24.3 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  33.64 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  23.33 
 
 
472 aa  77  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  24.46 
 
 
464 aa  77  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  23.96 
 
 
457 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.76 
 
 
476 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  24.49 
 
 
442 aa  76.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  27.08 
 
 
443 aa  76.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.3 
 
 
465 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  31.85 
 
 
445 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  24.05 
 
 
506 aa  75.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.93 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1601  glucuronide permease  26 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.8 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.8 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  29.21 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  23.47 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.94 
 
 
460 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  29.75 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  29.49 
 
 
476 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>