194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2493 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2493  hypothetical protein  100 
 
 
539 aa  1123    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2495  hypothetical protein  40.29 
 
 
772 aa  352  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0157541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  40.3 
 
 
760 aa  326  5e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2714  hypothetical protein  38.46 
 
 
663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000124871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2269  hypothetical protein  39.08 
 
 
329 aa  149  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.681202  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0544  hypothetical protein  33.21 
 
 
310 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1232  hypothetical protein  25.61 
 
 
559 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000146578  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  35.43 
 
 
245 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  35.81 
 
 
301 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  31.73 
 
 
370 aa  108  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  32.64 
 
 
289 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0833  putative lipoprotein  31.82 
 
 
341 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000110547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  31.05 
 
 
223 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2101  hypothetical protein  31.9 
 
 
356 aa  99.4  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00076564  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  34.09 
 
 
233 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  37.22 
 
 
276 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  31.25 
 
 
230 aa  97.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  32.62 
 
 
224 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0977  hypothetical protein  31.01 
 
 
381 aa  96.3  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000230443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2515  hypothetical protein  30.87 
 
 
361 aa  96.3  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000085485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0572  hypothetical protein  30.72 
 
 
386 aa  95.9  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  30.33 
 
 
226 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2239  hypothetical protein  32.82 
 
 
330 aa  92  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0453686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  29.92 
 
 
226 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  29.92 
 
 
226 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  30.74 
 
 
276 aa  90.5  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2986  hypothetical protein  27.57 
 
 
294 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0027982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 
768 aa  89.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1267  protein of unknown function DUF323  35.85 
 
 
270 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  31.03 
 
 
225 aa  89.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  33.68 
 
 
327 aa  87  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  31.28 
 
 
366 aa  86.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  28.92 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  28.91 
 
 
922 aa  84.3  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  29.31 
 
 
225 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  30.13 
 
 
214 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  25.09 
 
 
781 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  32.08 
 
 
587 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  30.09 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  32.28 
 
 
263 aa  77  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 
617 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  30.77 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  29.17 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  27.45 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.22 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 
639 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  24.58 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 
639 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  26.36 
 
 
262 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1056  hypothetical protein  32.5 
 
 
201 aa  72.8  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000574228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  29.48 
 
 
475 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  26.72 
 
 
296 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  27.87 
 
 
611 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  33.15 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  25.44 
 
 
925 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 
623 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 
621 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  34.45 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  25.46 
 
 
620 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  24.72 
 
 
603 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 
618 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  25.74 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  34.17 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  25.65 
 
 
802 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  26.34 
 
 
285 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
637 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  23.99 
 
 
625 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  22.88 
 
 
636 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  24.07 
 
 
1911 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  31.97 
 
 
323 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  26.56 
 
 
254 aa  63.5  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  26.43 
 
 
1518 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  28.29 
 
 
298 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  25.37 
 
 
267 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  24.53 
 
 
287 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  24.7 
 
 
929 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.7 
 
 
820 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 
637 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  29.77 
 
 
1201 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  25.67 
 
 
426 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  23.79 
 
 
416 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  23.1 
 
 
877 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  23.44 
 
 
346 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  36.27 
 
 
334 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  26.39 
 
 
267 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  24.13 
 
 
1196 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  25.7 
 
 
952 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 
715 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.16 
 
 
517 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0252  protein of unknown function DUF323  27.24 
 
 
262 aa  58.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.531607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  22.52 
 
 
305 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  24.62 
 
 
664 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  29.87 
 
 
692 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  24.14 
 
 
740 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  25 
 
 
616 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0206  protein of unknown function DUF323  27.24 
 
 
287 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  26.22 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  30.54 
 
 
1104 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>