48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13292 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  100 
 
 		 553 aa  1131    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  42.22 
 
 		 415 aa  317  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  35.53 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  34.94 
 
 		 552 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  27.26 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  32.38 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.48 
 
 		 489 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  26.01 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  22.93 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  22.7 
 
 		 523 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  24.55 
 
 		 534 aa  90.5  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  24.85 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.07 
 
 		 694 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  23.49 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  24.15 
 
 		 579 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  20.42 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  26.35 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1210 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  26.44 
 
 		 527 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  23.97 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  23.86 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  22.07 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  27.54 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.93 
 
 		 673 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  22.91 
 
 		 404 aa  54.7  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  27.54 
 
 		 466 aa  51.2  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.9 
 
 		 974 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  25.84 
 
 		 587 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  25.23 
 
 		 499 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  26.34 
 
 		 595 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.83 
 
 		 1194 aa  47.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  27.27 
 
 		 573 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.36 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  26.21 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.23 
 
 		 501 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  29.27 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  22.86 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  22.8 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  25.54 
 
 		 505 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  33.63 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  25.79 
 
 		 526 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1104 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.86 
 
 		 503 aa  45.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1612 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  25.93 
 
 		 494 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  25.56 
 
 		 499 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  27.19 
 
 		 506 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  27.93 
 
 		 526 aa  43.5  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>