109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13258 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1359  fatty acid desaturase  80.19 
 
 
413 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1377  fatty acid desaturase  80.19 
 
 
413 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1768  fatty acid desaturase  77.06 
 
 
415 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.773532  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1393  fatty acid desaturase  80.68 
 
 
413 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.760426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4698  fatty acid desaturase  75.64 
 
 
418 aa  688    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13258  linoleoyl-CoA desaturase  100 
 
 
427 aa  884    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.645092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3620  fatty acid desaturase  61.48 
 
 
440 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1088  fatty acid desaturase  63.96 
 
 
418 aa  545  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3619  fatty acid desaturase  59.85 
 
 
400 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4132  fatty acid desaturase  61.56 
 
 
413 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0319969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1091  fatty acid desaturase  59.34 
 
 
469 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.171543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1090  fatty acid desaturase  53.9 
 
 
428 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0402  fatty acid desaturase  59.17 
 
 
368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0411  fatty acid desaturase  59.17 
 
 
368 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.137952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0390  fatty acid desaturase  59.17 
 
 
368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0788312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3667  fatty acid desaturase  56.28 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1045  fatty acid desaturase  57.29 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5222  fatty acid desaturase  56.04 
 
 
382 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3575  fatty acid desaturase  58.56 
 
 
361 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3648  fatty acid desaturase  58.56 
 
 
361 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0690556  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3580  fatty acid desaturase  58.84 
 
 
361 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5195  fatty acid desaturase  57.97 
 
 
360 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532501  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1055  fatty acid desaturase  54.85 
 
 
369 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5213  fatty acid desaturase  55 
 
 
357 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192776  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2077  fatty acid desaturase  52.59 
 
 
380 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160477  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4480  fatty acid desaturase  50.41 
 
 
409 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3230  fatty acid desaturase  51.27 
 
 
394 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0195  fatty acid desaturase  50.28 
 
 
391 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.670555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0251  fatty acid desaturase  52.29 
 
 
401 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22420  fatty acid desaturase  51.43 
 
 
452 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2220  fatty acid desaturase  51.78 
 
 
380 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6974  fatty acid desaturase  51.44 
 
 
360 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5061  fatty acid desaturase  49.72 
 
 
408 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.287786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5661  fatty acid desaturase  50.57 
 
 
378 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23250  fatty acid desaturase  50.42 
 
 
452 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.183691  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2413  fatty acid desaturase  50.56 
 
 
397 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00111814  hitchhiker  0.00501849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1576  fatty acid desaturase  49.58 
 
 
400 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3767  fatty acid desaturase  49.15 
 
 
384 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000585865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2658  fatty acid desaturase  49.56 
 
 
760 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5246  fatty acid desaturase  40.49 
 
 
464 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4814  fatty acid desaturase  47.7 
 
 
345 aa  352  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0143092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1400  fatty acid desaturase  47.7 
 
 
356 aa  351  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2268  fatty acid desaturase  40.25 
 
 
464 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2315  fatty acid desaturase  40.25 
 
 
464 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2307  fatty acid desaturase  40.25 
 
 
464 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0361  fatty acid desaturase  45.13 
 
 
390 aa  346  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1628  fatty acid desaturase  46.84 
 
 
377 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3070  fatty acid desaturase  46.72 
 
 
357 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1259  fatty acid desaturase  45.98 
 
 
369 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1276  fatty acid desaturase  45.98 
 
 
369 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.38446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03878  DesA3_2  44.23 
 
 
373 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1285  fatty acid desaturase  44.29 
 
 
380 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.725631  normal  0.0739188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2285  fatty acid desaturase  45.11 
 
 
382 aa  325  8.000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0386211  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64610  hypothetical protein  46.86 
 
 
370 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454442  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0669  fatty acid desaturase  48.28 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5610  hypothetical protein  46.29 
 
 
362 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0142  fatty acid desaturase  41.87 
 
 
448 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02773  putative fatty acid desaturase  42 
 
 
387 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.509606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2357  fatty acid desaturase  38.52 
 
 
370 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  hitchhiker  0.0075773 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07355  linoleoyl-CoA desaturase  22.71 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.163467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  25.66 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1748  linoleoyl-CoA desaturase  23.99 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0374  Linoleoyl-CoA desaturase  25.62 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1080  Linoleoyl-CoA desaturase  27.69 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5632  Linoleoyl-CoA desaturase  27.21 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3764  fatty acid desaturase  22.83 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30630  predicted protein  35.25 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44622  predicted protein  22.11 
 
 
485 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  25 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1021  linoleoyl-CoA desaturase  27.36 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3380  Linoleoyl-CoA desaturase  25.62 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3187  linoleoyl-CoA desaturase  25.63 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3204  Linoleoyl-CoA desaturase  23.24 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55137  acyl desaturase  28.99 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0579  Linoleoyl-CoA desaturase  22.48 
 
 
378 aa  63.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  37.04 
 
 
362 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  24.01 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3373  fatty acid desaturase  39.02 
 
 
346 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266516  hitchhiker  0.00138514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11580  fatty acid desaturase  24.6 
 
 
368 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0346  fatty acid desaturase  36.05 
 
 
366 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2789  fatty acid desaturase  25.7 
 
 
358 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302627  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17840  predicted protein  28.02 
 
 
466 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29780  predicted protein  28.02 
 
 
465 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000374756 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28687  predicted protein  24.04 
 
 
459 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00664643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0898  Linoleoyl-CoA desaturase  19.94 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  37.18 
 
 
364 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  32.95 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  40.58 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0225  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382399  hitchhiker  0.0015365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  38.67 
 
 
342 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22510  predicted protein  24.1 
 
 
453 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  35.9 
 
 
366 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2125  fatty acid desaturase  35.9 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0362357  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4881  fatty acid desaturase  32 
 
 
346 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0158  fatty acid desaturase  37.88 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.655181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30440  fatty acid desaturase  36.36 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0468846  normal  0.466134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  27.86 
 
 
347 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4604  fatty acid desaturase  21.43 
 
 
386 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  35.71 
 
 
357 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>