More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12319 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  53.85 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  56.15 
 
 		 298 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  52.86 
 
 		 302 aa  318  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  50.51 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  50.17 
 
 		 302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  50.52 
 
 		 302 aa  295  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  51.32 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  50.99 
 
 		 310 aa  291  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  47.14 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  46.84 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  52.33 
 
 		 304 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  52.33 
 
 		 304 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  52.33 
 
 		 304 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  48.8 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  38.23 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  42.62 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  40.79 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.26 
 
 		 461 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  35.69 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.66 
 
 		 482 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  59.35 
 
 		 118 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.3 
 
 		 484 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.56 
 
 		 363 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.2 
 
 		 411 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  33.96 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.19 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  31.76 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  28.38 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  30.82 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 296 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  40.58 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  30.77 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  31.72 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.03 
 
 		 369 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.2 
 
 		 475 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  30.07 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.19 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.19 
 
 		 361 aa  90.5  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  40.8 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  37.3 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  40.8 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  41.13 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  27.34 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  33.18 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  36.73 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  40.52 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  38.79 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  40.52 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  37.39 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.93 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  39.66 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  37.72 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>