54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12258 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  471  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  60.74 
 
 
245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  59.18 
 
 
245 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  59.18 
 
 
245 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  59.18 
 
 
245 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  55.37 
 
 
245 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  43.51 
 
 
246 aa  188  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  44.77 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  43.93 
 
 
245 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  41.84 
 
 
245 aa  174  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  41.42 
 
 
245 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  40.25 
 
 
245 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  43.8 
 
 
242 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  39.75 
 
 
246 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  40.24 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  40.16 
 
 
246 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  39.83 
 
 
247 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  39.39 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  38.91 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  40.41 
 
 
246 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  38.33 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  36.13 
 
 
245 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  36.21 
 
 
255 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  41.15 
 
 
247 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  39.33 
 
 
246 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  33.88 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  38.11 
 
 
247 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  38.33 
 
 
244 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  36.51 
 
 
249 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  34.62 
 
 
245 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  37.93 
 
 
234 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  32.23 
 
 
247 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  38.78 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  27.62 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  29.96 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  25.39 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  24.69 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  23.42 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  21.34 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  28.03 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.79 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  30.23 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_302  hypothetical protein  26.2 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  21.1 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  25.95 
 
 
239 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  21.95 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  19.4 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  24.36 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  20.83 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  23.02 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  18.99 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  24.77 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  31.28 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  23.55 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>