128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1143 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  85.21 
 
 		 210 aa  298  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  85.21 
 
 		 209 aa  298  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  83.93 
 
 		 204 aa  296  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  83.53 
 
 		 207 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  80.81 
 
 		 226 aa  290  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  80.81 
 
 		 226 aa  290  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  80 
 
 		 201 aa  287  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  71.6 
 
 		 236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  71.25 
 
 		 228 aa  232  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  48.37 
 
 		 343 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  42.38 
 
 		 356 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  38.1 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  38.38 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  37.63 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  37.63 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  37.63 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  39.25 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  37.7 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  36.7 
 
 		 228 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  38.98 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  38.98 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  38.67 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  36.61 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  37.1 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  39.04 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  41.32 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  41.08 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  41.24 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  38.34 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  39.56 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  39.26 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  40.61 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  39.33 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  39.66 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  40.24 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  36.27 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  39.01 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  42.42 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  39.53 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  39.53 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  39.53 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  38.89 
 
 		 202 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  38.25 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  39.39 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  37.72 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  37.72 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1891  hypothetical protein  35.56 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.248989  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  36 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  37.35 
 
 		 173 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  37.58 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  36.97 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  38.18 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  35.98 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  34.29 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0992  protein of unknown function DUF88  35.03 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  35.4 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  40.46 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  37.58 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  32.93 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  35.76 
 
 		 165 aa  94.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  36.09 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  34.9 
 
 		 165 aa  92  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  36.2 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  36.91 
 
 		 165 aa  91.7  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  34.34 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  35.1 
 
 		 158 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  32.21 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2781  hypothetical protein  32.28 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  34.87 
 
 		 167 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  34.87 
 
 		 167 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2873  protein of unknown function DUF88  32.28 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  32.53 
 
 		 287 aa  86.3  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  34.66 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  35.76 
 
 		 158 aa  84.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  33.33 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  35.33 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4769  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4644  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54947  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  34.21 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4782  hypothetical protein  35.1 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  33.12 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  34.44 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1288  hypothetical protein  35.33 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0893  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  32.28 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  29.19 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1080  hypothetical protein  28.99 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1173  hypothetical protein  30.46 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.751958 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05689  hypothetical protein  31.58 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1148  hypothetical protein  30.41 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.882158  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  31.13 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  31.29 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1080  hypothetical protein  29.93 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  29.53 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  28.48 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000074  hypothetical protein  30.32 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  30.86 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>