141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000074 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000074  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  336  8e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05689  hypothetical protein  96.3 
 
 
162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  70.51 
 
 
157 aa  228  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1288  hypothetical protein  62.82 
 
 
157 aa  213  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  59.35 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1148  hypothetical protein  57.32 
 
 
157 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.882158  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1080  hypothetical protein  55.77 
 
 
170 aa  189  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0893  hypothetical protein  56.49 
 
 
158 aa  188  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  55.13 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  57.05 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3490  hypothetical protein  56.41 
 
 
157 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1080  hypothetical protein  52.5 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  51.88 
 
 
167 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1362  hypothetical protein  53.21 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0533358  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1261  hypothetical protein  53.85 
 
 
159 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0151498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1173  hypothetical protein  52.26 
 
 
157 aa  176  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.751958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  53.85 
 
 
159 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0372  hypothetical protein  51.85 
 
 
184 aa  176  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000170684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4769  hypothetical protein  53.85 
 
 
159 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2790  hypothetical protein  53.85 
 
 
157 aa  175  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4644  hypothetical protein  53.85 
 
 
159 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54947  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4301  hypothetical protein  51.92 
 
 
158 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000509766  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  53.21 
 
 
157 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3258  hypothetical protein  50.32 
 
 
157 aa  174  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1154  hypothetical protein  53.21 
 
 
157 aa  174  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4782  hypothetical protein  53.21 
 
 
159 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  52.56 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  53.21 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  53.21 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  53.21 
 
 
157 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1157  hypothetical protein  50.62 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111181  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4666  hypothetical protein  51.28 
 
 
158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0134  hypothetical protein  48.72 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  48.32 
 
 
158 aa  163  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1028  hypothetical protein  49.68 
 
 
157 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.873196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  36.94 
 
 
165 aa  118  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  35.85 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  36.18 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  37.84 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  35.85 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  30.82 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  31.71 
 
 
195 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  29.34 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  30.82 
 
 
192 aa  80.9  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  29.03 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  30.32 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  28.4 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  29.94 
 
 
207 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  27.74 
 
 
226 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  27.74 
 
 
226 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  28.39 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  29.88 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  29.88 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  29.88 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  28.39 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  28.39 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  29.27 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  31.58 
 
 
304 aa  67.4  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  28.66 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  29.27 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0165  protein of unknown function DUF88  26.97 
 
 
343 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.334163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  28.3 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  28.3 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  28.75 
 
 
216 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  28.75 
 
 
219 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  29.75 
 
 
213 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  28.3 
 
 
217 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  28.76 
 
 
228 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  29.34 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  25.15 
 
 
214 aa  61.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  30.06 
 
 
194 aa  61.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  27.1 
 
 
275 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  29.01 
 
 
207 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  27.5 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  27.45 
 
 
508 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  26.14 
 
 
564 aa  57.8  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  26.8 
 
 
507 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  26.22 
 
 
228 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  26.8 
 
 
498 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  26.8 
 
 
501 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  26.83 
 
 
216 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  25.16 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  25.16 
 
 
192 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  26.8 
 
 
496 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  27.27 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  26.8 
 
 
498 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  25.79 
 
 
195 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  26.8 
 
 
498 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  27.16 
 
 
206 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  26.71 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  27.71 
 
 
236 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  27.78 
 
 
206 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  32.63 
 
 
190 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  28.03 
 
 
205 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  28.1 
 
 
381 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  26.22 
 
 
209 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  25.95 
 
 
203 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  27.92 
 
 
294 aa  55.1  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>