132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0590 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  100 
 
 		 115 aa  223  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  54.46 
 
 		 132 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  55.56 
 
 		 138 aa  115  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  63.41 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  51.82 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  51.4 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  66.67 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  66.67 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  44.44 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  44.12 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  51.69 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  52.27 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  56.41 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  57.35 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  43.59 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  46.07 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10191  hypothetical protein  42.31 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10201  hypothetical protein  39.74 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  42.7 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  41.11 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  38.61 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  43.04 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  49.23 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  41.25 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  44.44 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  36.96 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  42.31 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  37.65 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  39.51 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  44 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  42.67 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  38.46 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  35.23 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  36.26 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  36.26 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  48.44 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  32.94 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  46.25 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  32.14 
 
 		 188 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  32.35 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  35.06 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  35.11 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  29.17 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  35.06 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  29.17 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  25.74 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  36.49 
 
 		 360 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  34.62 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  38.16 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  30.59 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  34.69 
 
 		 220 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  37.08 
 
 		 205 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  34.62 
 
 		 199 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  35.71 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  49.12 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  29.67 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  28.95 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  30.77 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  32.31 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  29.67 
 
 		 238 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  25.58 
 
 		 185 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  28.95 
 
 		 198 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  35.38 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  28.95 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  29.49 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  36.36 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  36.76 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  28.95 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  30 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  29.87 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  27.63 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  28.42 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  32.69 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  33.82 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  45.76 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  29.67 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  31.94 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  28.95 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  29.67 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  32.35 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  32.94 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>