108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1361 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1117  photolyase family protein  67.87 
 
 		 505 aa  717    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.322412  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1361  photolyase family protein  100 
 
 		 498 aa  1027    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.174089  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04781  hypothetical protein  47.56 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.289419  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04471  hypothetical protein  47.76 
 
 		 496 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77539  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0726  hypothetical protein  48.38 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15641  hypothetical protein  48.38 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.681049 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04871  hypothetical protein  47.47 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0423  hypothetical protein  46.34 
 
 		 496 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.27403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7174  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.91 
 
 		 492 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1823  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  47.39 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0760009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2797  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.76 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2542  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.38 
 
 		 537 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2030  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.16 
 
 		 519 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0662893  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26230  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.58 
 
 		 532 aa  339  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355559  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3925  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.21 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1785  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein protein  36.87 
 
 		 519 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4251  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.79 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0009  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.92 
 
 		 508 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3318  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.05 
 
 		 497 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.420687  hitchhiker  0.00000494763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3689  hypothetical protein  35.24 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.116484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2809  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  35.02 
 
 		 512 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4487  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.62 
 
 		 506 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1000  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.14 
 
 		 511 aa  253  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02017  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.4 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.571234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1204  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.32 
 
 		 520 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3982  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.69 
 
 		 507 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1728  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.58 
 
 		 513 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2999  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.14 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248063 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.67 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2689  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.67 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01727  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.41 
 
 		 525 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0531  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.67 
 
 		 511 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.548466  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5845  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.98 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2281  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.56 
 
 		 507 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0599  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.13 
 
 		 508 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.315159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0425  hypothetical protein  35.26 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000280647  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3755  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.7 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1608  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.19 
 
 		 511 aa  237  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3022  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.6 
 
 		 508 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3641  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.91 
 
 		 508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3101  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.19 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2732  hypothetical protein  32.21 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5626  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.26 
 
 		 534 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147008  normal  0.0556848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2169  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.49 
 
 		 498 aa  233  7.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07801  deoxyribodipyrimidine photolyase related protein  29.54 
 
 		 511 aa  232  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1054  hypothetical protein  30.54 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000795  DNA photolyase  33.19 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3804  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.34 
 
 		 508 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206805 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3077  hypothetical protein  32.34 
 
 		 508 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0896  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.32 
 
 		 524 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0777  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.1 
 
 		 528 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06692  hypothetical protein  32.09 
 
 		 514 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5454  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.06 
 
 		 533 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2394  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.88 
 
 		 522 aa  226  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2956  hypothetical protein  36.52 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.195961 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0260  hypothetical protein  29.69 
 
 		 512 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1396  DNA photolyase  30.21 
 
 		 524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.64137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0524  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.66 
 
 		 521 aa  223  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0821  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.8 
 
 		 525 aa  223  8e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.414989 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1235  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.36 
 
 		 511 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00923753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3490  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.03 
 
 		 505 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.49 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2968  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.49 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.278599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2939  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.49 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1551  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.92 
 
 		 516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585368  normal  0.610204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3929  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.31 
 
 		 531 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3526  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.01 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0265  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.87 
 
 		 510 aa  213  9e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.319874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0441  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.22 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3704  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.57 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0429  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.05 
 
 		 525 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1250  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.37 
 
 		 513 aa  210  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000733779 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3928  BCCT transporter  32.24 
 
 		 508 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.240048  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4169  hypothetical protein  31.44 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3270  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.67 
 
 		 494 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4518  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.37 
 
 		 533 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2791  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.49 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000121396  hitchhiker  0.0000216403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0458  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.96 
 
 		 521 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0467  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.96 
 
 		 521 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2055  putative alpha-deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.1 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.527245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3872  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.78 
 
 		 521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0335  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.78 
 
 		 522 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3082  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.41 
 
 		 510 aa  199  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47785  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1806  hypothetical protein  30.49 
 
 		 523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0647  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.95 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2497  hypothetical protein  31.13 
 
 		 569 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1265  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  33.59 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.61 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  26.86 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.83 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.73 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  24.17 
 
 		 303 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.99 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.92 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.49 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.05 
 
 		 486 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.14 
 
 		 500 aa  47  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.82 
 
 		 477 aa  47  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43003  predicted protein  25.34 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.832505  normal  0.0789751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>