105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0009 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0009  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  100 
 
 		 508 aa  1048    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4251  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  85.03 
 
 		 508 aa  909    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3318  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  59.96 
 
 		 497 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.420687  hitchhiker  0.00000494763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1171  hypothetical protein  44.8 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4487  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.59 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3982  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.54 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1000  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.17 
 
 		 511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5626  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43 
 
 		 534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147008  normal  0.0556848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2394  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.38 
 
 		 522 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5454  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.58 
 
 		 533 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3101  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.59 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1728  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2809  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  40.04 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2689  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.75 
 
 		 508 aa  386  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14747 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0260  hypothetical protein  38.98 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1204  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.6 
 
 		 520 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3689  hypothetical protein  41.42 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.116484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1785  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein protein  41.58 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0599  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.39 
 
 		 508 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.315159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0896  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.47 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2281  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.49 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02017  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.11 
 
 		 512 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.571234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2732  hypothetical protein  41.87 
 
 		 508 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3022  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.27 
 
 		 508 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2999  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.35 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3641  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.84 
 
 		 508 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175337 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.99 
 
 		 502 aa  363  4e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1235  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.9 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00923753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1396  DNA photolyase  40.43 
 
 		 524 aa  359  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.64137  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2169  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.28 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4518  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.13 
 
 		 533 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5845  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.99 
 
 		 509 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1250  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.38 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000733779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2956  hypothetical protein  40.72 
 
 		 508 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.195961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0265  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.87 
 
 		 510 aa  345  8e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.319874  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3077  hypothetical protein  39.6 
 
 		 508 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2055  putative alpha-deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.1 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.527245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3804  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.21 
 
 		 508 aa  339  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3755  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.51 
 
 		 532 aa  335  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0531  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.88 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.548466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0821  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.26 
 
 		 525 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.414989 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1608  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.08 
 
 		 511 aa  333  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3490  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.39 
 
 		 505 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000795  DNA photolyase  36.28 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06692  hypothetical protein  35.71 
 
 		 514 aa  329  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01727  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.59 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3270  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.16 
 
 		 494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.48 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2968  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.48 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.278599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2939  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.48 
 
 		 496 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3082  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.79 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47785  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0524  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.86 
 
 		 521 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0441  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.87 
 
 		 525 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0647  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.05 
 
 		 528 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0429  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.59 
 
 		 525 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0467  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.7 
 
 		 521 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0458  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.67 
 
 		 521 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0425  hypothetical protein  41.84 
 
 		 516 aa  310  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000280647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3872  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.29 
 
 		 521 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0777  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.56 
 
 		 528 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1054  hypothetical protein  34.59 
 
 		 521 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1551  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.27 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585368  normal  0.610204 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3526  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.08 
 
 		 525 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3928  BCCT transporter  37.85 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.240048  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07801  deoxyribodipyrimidine photolyase related protein  32.21 
 
 		 511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3704  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.2 
 
 		 525 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4169  hypothetical protein  35.69 
 
 		 521 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0335  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.66 
 
 		 522 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2791  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.98 
 
 		 500 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000121396  hitchhiker  0.0000216403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2497  hypothetical protein  37.96 
 
 		 569 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1806  hypothetical protein  35.07 
 
 		 523 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15641  hypothetical protein  33.26 
 
 		 496 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.681049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0726  hypothetical protein  33.48 
 
 		 496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3929  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.11 
 
 		 531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7174  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.85 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1361  photolyase family protein  33.92 
 
 		 498 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.174089  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1117  photolyase family protein  34.18 
 
 		 505 aa  276  9e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.322412  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04471  hypothetical protein  28.99 
 
 		 496 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77539  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0423  hypothetical protein  29.63 
 
 		 496 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.27403  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04781  hypothetical protein  28.74 
 
 		 496 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.289419  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3925  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.13 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2030  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.81 
 
 		 519 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0662893  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1823  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.95 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0760009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04871  hypothetical protein  29.82 
 
 		 496 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2797  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.57 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2542  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.07 
 
 		 537 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26230  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.47 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355559  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1265  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  55.36 
 
 		 186 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224709 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  28.41 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  28.41 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.5 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  26.7 
 
 		 270 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  25.59 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1867  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  25.66 
 
 		 293 aa  47  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.66 
 
 		 486 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  26.57 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  25.13 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  25.73 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  25.24 
 
 		 476 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.75 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499221 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>