124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2030 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2030  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  100 
 
 		 519 aa  1059    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0662893  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7174  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.63 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1361  photolyase family protein  42.16 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.174089  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1823  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.82 
 
 		 502 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0760009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04871  hypothetical protein  36.29 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1117  photolyase family protein  40.09 
 
 		 505 aa  350  3e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.322412  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04781  hypothetical protein  36.53 
 
 		 496 aa  346  7e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.289419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5454  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.36 
 
 		 533 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04471  hypothetical protein  36.33 
 
 		 496 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77539  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0423  hypothetical protein  36.58 
 
 		 496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.27403  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0726  hypothetical protein  34.3 
 
 		 496 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2797  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.36 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15641  hypothetical protein  33.53 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.681049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0896  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.62 
 
 		 524 aa  324  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1728  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.48 
 
 		 513 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483675  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3925  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.56 
 
 		 476 aa  316  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2281  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.89 
 
 		 507 aa  313  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5626  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.36 
 
 		 534 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147008  normal  0.0556848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1785  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein protein  37.04 
 
 		 519 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2999  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.52 
 
 		 513 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0821  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.8 
 
 		 525 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.414989 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3804  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.98 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3689  hypothetical protein  35.98 
 
 		 512 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.116484  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02017  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.53 
 
 		 512 aa  302  9e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.571234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2732  hypothetical protein  36.13 
 
 		 508 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1608  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.56 
 
 		 511 aa  298  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1204  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.08 
 
 		 520 aa  296  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3641  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.36 
 
 		 508 aa  296  7e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3022  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.94 
 
 		 508 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3077  hypothetical protein  36.94 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1000  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.59 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3101  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.68 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2809  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  36.17 
 
 		 512 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0599  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.67 
 
 		 508 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.315159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2542  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.07 
 
 		 537 aa  293  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26230  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.42 
 
 		 532 aa  293  7e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355559  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2394  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.02 
 
 		 522 aa  292  8e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1396  DNA photolyase  37.52 
 
 		 524 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.64137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1235  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.58 
 
 		 511 aa  286  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00923753  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.92 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1250  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.99 
 
 		 513 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000733779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2956  hypothetical protein  37.18 
 
 		 508 aa  283  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.195961 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3755  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.79 
 
 		 532 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3928  BCCT transporter  37.7 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.240048  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2169  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.09 
 
 		 498 aa  277  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4251  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.41 
 
 		 508 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3318  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.85 
 
 		 497 aa  276  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.420687  hitchhiker  0.00000494763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4518  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.87 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4487  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.89 
 
 		 506 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01727  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.42 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0531  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.5 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.548466  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0425  hypothetical protein  34.74 
 
 		 516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000280647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0009  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.81 
 
 		 508 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07801  deoxyribodipyrimidine photolyase related protein  30.63 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0777  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.89 
 
 		 528 aa  264  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0524  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.46 
 
 		 521 aa  259  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1551  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.95 
 
 		 516 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585368  normal  0.610204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1054  hypothetical protein  30.55 
 
 		 521 aa  256  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2689  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.67 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2055  putative alpha-deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.56 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.527245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0260  hypothetical protein  30.47 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06692  hypothetical protein  33.21 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3982  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.41 
 
 		 507 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134489 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3704  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.69 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4169  hypothetical protein  32.69 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3526  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.14 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000795  DNA photolyase  31.26 
 
 		 514 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1171  hypothetical protein  32.54 
 
 		 503 aa  246  9e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0429  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.31 
 
 		 525 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0335  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.29 
 
 		 522 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0441  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.97 
 
 		 525 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0265  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.52 
 
 		 510 aa  240  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.319874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3872  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.75 
 
 		 521 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0467  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.77 
 
 		 521 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0458  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.64 
 
 		 521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5845  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.3 
 
 		 509 aa  232  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3929  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  30.13 
 
 		 531 aa  229  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3082  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.99 
 
 		 510 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47785  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1806  hypothetical protein  30.02 
 
 		 523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0647  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.8 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3490  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.82 
 
 		 505 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3270  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.54 
 
 		 494 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2497  hypothetical protein  29.11 
 
 		 569 aa  200  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2939  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.47 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.47 
 
 		 525 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2968  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.47 
 
 		 525 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.278599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2791  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.3 
 
 		 500 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000121396  hitchhiker  0.0000216403 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1265  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  39.81 
 
 		 186 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.83 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.38 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.6 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.79 
 
 		 452 aa  50.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43003  predicted protein  28.57 
 
 		 565 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.832505  normal  0.0789751 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51395  predicted protein  28.57 
 
 		 565 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00141783 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.41 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.79 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.82 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.09 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.82 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.82 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>