93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1235 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1235  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  100 
 
 		 511 aa  1060    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00923753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1396  DNA photolyase  58.48 
 
 		 524 aa  621  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.64137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0821  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  55.42 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.414989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4518  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  56.21 
 
 		 533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1250  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  54.47 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000733779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2055  putative alpha-deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  55.89 
 
 		 510 aa  521  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.527245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1000  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  48.91 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5454  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  50.59 
 
 		 533 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2956  hypothetical protein  47.66 
 
 		 508 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.195961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1728  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  47.8 
 
 		 513 aa  481  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2281  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  48.14 
 
 		 507 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3101  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  45.58 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5626  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  47.84 
 
 		 534 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147008  normal  0.0556848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0599  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  47.24 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.315159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1204  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  48.7 
 
 		 520 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2394  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.92 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3804  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.15 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3755  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.17 
 
 		 532 aa  456  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1608  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.18 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3077  hypothetical protein  45.76 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3641  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.34 
 
 		 508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3022  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.14 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2732  hypothetical protein  46.09 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1785  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein protein  45.15 
 
 		 519 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2999  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  45.35 
 
 		 513 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02017  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.91 
 
 		 512 aa  440  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.571234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0896  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  45.31 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3928  BCCT transporter  47.38 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.240048  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3689  hypothetical protein  44.36 
 
 		 512 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.116484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2809  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  43.55 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0260  hypothetical protein  42.83 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1171  hypothetical protein  42.83 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07801  deoxyribodipyrimidine photolyase related protein  38.49 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1054  hypothetical protein  38.57 
 
 		 521 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3982  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.42 
 
 		 507 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0335  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.26 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0441  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.67 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4487  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.36 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0777  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.23 
 
 		 528 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3318  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.72 
 
 		 497 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.420687  hitchhiker  0.00000494763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2169  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.82 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0009  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.1 
 
 		 508 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01727  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.94 
 
 		 525 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0467  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.7 
 
 		 521 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3929  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.61 
 
 		 531 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000795  DNA photolyase  39.02 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06692  hypothetical protein  39.37 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4251  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.54 
 
 		 508 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0524  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.45 
 
 		 521 aa  359  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0531  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.88 
 
 		 511 aa  359  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.548466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0458  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.67 
 
 		 521 aa  359  7e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3872  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.47 
 
 		 521 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3526  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.19 
 
 		 525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0429  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.42 
 
 		 525 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1806  hypothetical protein  39.13 
 
 		 523 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3704  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.61 
 
 		 525 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1551  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.26 
 
 		 516 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585368  normal  0.610204 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5845  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.37 
 
 		 509 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4169  hypothetical protein  39.22 
 
 		 521 aa  348  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.08 
 
 		 502 aa  346  7e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2689  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.8 
 
 		 508 aa  342  1e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14747 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0265  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.29 
 
 		 510 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.319874  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0425  hypothetical protein  39.73 
 
 		 516 aa  329  7e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000280647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2497  hypothetical protein  36.84 
 
 		 569 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.6 
 
 		 525 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2968  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.6 
 
 		 525 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.278599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2939  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.4 
 
 		 496 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3490  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.73 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0647  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.24 
 
 		 528 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2791  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.39 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000121396  hitchhiker  0.0000216403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3082  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.21 
 
 		 510 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47785  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3270  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  36.03 
 
 		 494 aa  287  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2030  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  35.58 
 
 		 519 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0662893  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7174  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.76 
 
 		 492 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1823  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  33.05 
 
 		 502 aa  256  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0760009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04781  hypothetical protein  29.04 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.289419  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0423  hypothetical protein  28.6 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.27403  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04471  hypothetical protein  28.97 
 
 		 496 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04871  hypothetical protein  28.97 
 
 		 496 aa  243  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2797  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  28.6 
 
 		 503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0726  hypothetical protein  26.78 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26230  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.04 
 
 		 532 aa  230  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355559  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15641  hypothetical protein  26.96 
 
 		 496 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.681049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3925  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  28.92 
 
 		 476 aa  226  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027073 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1361  photolyase family protein  31.36 
 
 		 498 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.174089  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1117  photolyase family protein  30.23 
 
 		 505 aa  219  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.322412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2542  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.82 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228868 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1265  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  48.94 
 
 		 186 aa  143  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224709 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  27.32 
 
 		 471 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  27.32 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.72 
 
 		 452 aa  47  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  23.25 
 
 		 270 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.37 
 
 		 500 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>