89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3804 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3928  BCCT transporter  88.19 
 
 		 508 aa  891    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.240048  normal  0.840759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2281  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  68.11 
 
 		 507 aa  700    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3641  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  60.67 
 
 		 508 aa  638    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175337 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3077  hypothetical protein  98.23 
 
 		 508 aa  1015    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3804  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  100 
 
 		 508 aa  1030    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.206805 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0599  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  67.13 
 
 		 508 aa  684    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.315159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1000  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  56.92 
 
 		 511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2394  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  55.71 
 
 		 522 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2809  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  53.47 
 
 		 512 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1785  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein protein  53.65 
 
 		 519 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00721619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1728  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  55.21 
 
 		 513 aa  541  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3689  hypothetical protein  52.47 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.116484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3101  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  53.65 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1204  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  52.87 
 
 		 520 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5454  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  56.86 
 
 		 533 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5626  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  54.26 
 
 		 534 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147008  normal  0.0556848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2999  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  52.28 
 
 		 513 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.248063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0896  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  54.17 
 
 		 524 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2732  hypothetical protein  52.47 
 
 		 508 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3022  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  52.47 
 
 		 508 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.619117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0260  hypothetical protein  46.77 
 
 		 512 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02017  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.92 
 
 		 512 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.571234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1235  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.15 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00923753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1396  DNA photolyase  50.1 
 
 		 524 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.64137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1250  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  49.5 
 
 		 513 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000733779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2956  hypothetical protein  47.81 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.195961 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0821  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  47.67 
 
 		 525 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.414989 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2055  putative alpha-deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  50.39 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.527245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1054  hypothetical protein  43.48 
 
 		 521 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0524  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.44 
 
 		 521 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000795  DNA photolyase  43.66 
 
 		 514 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4518  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  49.4 
 
 		 533 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1608  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  44.29 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0441  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.8 
 
 		 525 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06692  hypothetical protein  43.31 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0467  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.8 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3704  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.75 
 
 		 525 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3872  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.6 
 
 		 521 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0458  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.6 
 
 		 521 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4169  hypothetical protein  43.36 
 
 		 521 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01727  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  47.05 
 
 		 525 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3526  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.55 
 
 		 525 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5845  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.55 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0777  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.93 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0429  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  42.97 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4487  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.83 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3982  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.63 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2169  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.6 
 
 		 498 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3755  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.73 
 
 		 532 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07801  deoxyribodipyrimidine photolyase related protein  40.53 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0335  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.66 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0531  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  46.6 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.548466  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0425  hypothetical protein  42.86 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000280647  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1171  hypothetical protein  41.12 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2497  hypothetical protein  40.11 
 
 		 569 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1551  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.94 
 
 		 516 aa  381  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585368  normal  0.610204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2689  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.51 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3929  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.08 
 
 		 531 aa  355  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1806  hypothetical protein  41.12 
 
 		 523 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2012  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  41.99 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0009  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.21 
 
 		 508 aa  339  7e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4251  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.92 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3318  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.61 
 
 		 497 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.420687  hitchhiker  0.00000494763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2791  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  43.2 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000121396  hitchhiker  0.0000216403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0265  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  38.05 
 
 		 510 aa  303  7.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.319874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3490  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.65 
 
 		 505 aa  302  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2030  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.98 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0662893  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3082  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  39.8 
 
 		 510 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47785  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.31 
 
 		 525 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2968  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.31 
 
 		 525 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.278599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2939  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.31 
 
 		 496 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.119687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3270  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.45 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0647  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  40.13 
 
 		 528 aa  283  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1823  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  37.02 
 
 		 502 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0760009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7174  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  31.44 
 
 		 492 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04871  hypothetical protein  28.4 
 
 		 496 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0423  hypothetical protein  27.8 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.27403  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04781  hypothetical protein  29.64 
 
 		 496 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.289419  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04471  hypothetical protein  29.85 
 
 		 496 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.77539  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1361  photolyase family protein  32.34 
 
 		 498 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.174089  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26230  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  34.15 
 
 		 532 aa  229  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.355559  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0726  hypothetical protein  28.17 
 
 		 496 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2542  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  32.93 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228868 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15641  hypothetical protein  28.09 
 
 		 496 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.681049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3925  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.69 
 
 		 476 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2797  deoxyribodipyrimidine photolyase-related protein  29.25 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1117  photolyase family protein  30.55 
 
 		 505 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.322412  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1265  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  59.8 
 
 		 186 aa  137  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.224709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4168  hypothetical protein  44.83 
 
 		 122 aa  51.2  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>