More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1111 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  662    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  55.66 
 
 
326 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  54.87 
 
 
338 aa  301  9e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  43.75 
 
 
328 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  41.85 
 
 
331 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  43.45 
 
 
331 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  43.53 
 
 
327 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  49.81 
 
 
323 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  42.55 
 
 
328 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  42.27 
 
 
327 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  41.4 
 
 
331 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  43.67 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  48.12 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  42.33 
 
 
332 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  44.44 
 
 
342 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  41.03 
 
 
341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  35.38 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  29.19 
 
 
331 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  34.67 
 
 
330 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  35.79 
 
 
321 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  39.83 
 
 
486 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  29.85 
 
 
326 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  32.09 
 
 
333 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  33.33 
 
 
336 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  29.82 
 
 
327 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  30.18 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  28.37 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  29.82 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  35.12 
 
 
338 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  30.3 
 
 
323 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  37.95 
 
 
481 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  37 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
471 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2773  thiamine-monophosphate kinase  32.87 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1879  AIR synthase related protein domain protein  26.46 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  28.86 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  28.62 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  27.43 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0846  cell division GTPase-like protein  26.7 
 
 
438 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  28.31 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  33.09 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  28.31 
 
 
332 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  26.26 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0480  thiamine-monophosphate kinase  32.81 
 
 
288 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0539171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  26.5 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  31.96 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  33.83 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  29.88 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  27.46 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  29.58 
 
 
346 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  29.28 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.06 
 
 
344 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  28.49 
 
 
352 aa  59.3  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  33.18 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  33.18 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  28.51 
 
 
350 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  33.18 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  33.18 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  33.18 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 
339 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  33.18 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  33.18 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  24 
 
 
371 aa  59.3  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  32.62 
 
 
344 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  29.3 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  30.28 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  30.25 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.29 
 
 
741 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  32.88 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  34.33 
 
 
340 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  35.82 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2605  thiamine-monophosphate kinase  30.16 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2024  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.908086  normal  0.0114447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1042  thiamine monophosphate kinase  26.22 
 
 
273 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.242656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  30.6 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0447  thiamine-monophosphate kinase  30.15 
 
 
315 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  34.56 
 
 
327 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  30.28 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  22.94 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  30.68 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  25 
 
 
320 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1047  thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0928  thiamine-monophosphate kinase  26.67 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  32.24 
 
 
313 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  25.24 
 
 
440 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  31.34 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  28.12 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  29.77 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  32.9 
 
 
357 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  36.03 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  24.7 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  27.72 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.19 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  29.33 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>