More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0929 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  87.92 
 
 		 207 aa  371  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  85.43 
 
 		 198 aa  343  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  76.12 
 
 		 202 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  74.75 
 
 		 202 aa  314  7e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  74.26 
 
 		 202 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  62.8 
 
 		 210 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  59.9 
 
 		 205 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1356  SOS function regulatory protein, LexA repressor  60.7 
 
 		 205 aa  271  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14471  SOS function regulatory protein, LexA repressor  58.94 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.972775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  57.29 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.69 
 
 		 209 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  56.72 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  54.5 
 
 		 201 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.27 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.27 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  36.19 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  35.2 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.32 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.24 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  32.68 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  33.82 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  32.37 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  32.37 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  32.37 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  32.37 
 
 		 269 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  32.37 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  32.37 
 
 		 269 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.35 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  31.88 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  32.37 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  32.37 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  34.7 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  32.17 
 
 		 227 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  30.92 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  35.65 
 
 		 252 aa  104  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  28.37 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  32.84 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  27.64 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.17 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  35.82 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  28.71 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  28.71 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.17 
 
 		 196 aa  101  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  35.16 
 
 		 263 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  31.51 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.17 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  35.44 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  27.36 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  27.36 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  30.51 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.5 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.5 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.16 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  30.42 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  31.55 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  35.32 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  35.32 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  35.32 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  31.14 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  30.1 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.35 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  31.13 
 
 		 261 aa  98.6  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.21 
 
 		 200 aa  98.2  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.35 
 
 		 197 aa  98.2  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  31.33 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  28.16 
 
 		 207 aa  98.2  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  29.41 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.02 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.39 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  33.66 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2070  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.05 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  30.8 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  33.17 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.82 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  33.17 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 258 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.84 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  25.11 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  24.42 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  29.36 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  29.06 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  33.94 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.59 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  31.58 
 
 		 228 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  32.44 
 
 		 246 aa  95.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  30.6 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.58 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  29.29 
 
 		 239 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  29.46 
 
 		 240 aa  94.7  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  35.15 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  29.46 
 
 		 240 aa  94.7  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  29.05 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.43 
 
 		 252 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  33.66 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>