More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2158 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  100 
 
 
452 aa  930    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  34.74 
 
 
447 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
428 aa  133  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  25.26 
 
 
418 aa  127  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
549 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
479 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 
752 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.15 
 
 
1119 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.42 
 
 
872 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.88 
 
 
927 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 
475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.88 
 
 
1115 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.42 
 
 
1115 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.97 
 
 
1115 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.62 
 
 
1115 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
464 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  26.01 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  28.4 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  28.4 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  28.4 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  24.35 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  28.4 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  28.4 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  28.4 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
1002 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.51 
 
 
1099 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  25.93 
 
 
424 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.6 
 
 
461 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  28.22 
 
 
421 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  28.22 
 
 
421 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
470 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  28.22 
 
 
421 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.51 
 
 
442 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
429 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  24.08 
 
 
423 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  24.33 
 
 
423 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
443 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.75 
 
 
417 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  24.65 
 
 
437 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  25.51 
 
 
425 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  25.51 
 
 
425 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
445 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  26.12 
 
 
418 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  25.35 
 
 
451 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
1101 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
484 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
469 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.55 
 
 
403 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  28.1 
 
 
412 aa  103  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  22.88 
 
 
423 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  22.88 
 
 
423 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  22.88 
 
 
423 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  23.72 
 
 
1124 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
442 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
442 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  25.16 
 
 
433 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  23.41 
 
 
423 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  25.4 
 
 
444 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  25.4 
 
 
444 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  25.4 
 
 
444 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  23.41 
 
 
423 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
466 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
1184 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  26.97 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  26.97 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 
1118 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 
425 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  24.14 
 
 
425 aa  98.2  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
410 aa  98.2  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 
789 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  24.48 
 
 
480 aa  97.4  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 
789 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.42 
 
 
789 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.04 
 
 
472 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  24.82 
 
 
694 aa  97.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  24.67 
 
 
442 aa  97.1  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  21.81 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
475 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
1154 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
509 aa  94  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
441 aa  92.8  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  22.64 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
477 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
648 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
466 aa  91.3  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.44 
 
 
422 aa  90.9  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
512 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
450 aa  90.1  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.95 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
443 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 
1120 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
433 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.05 
 
 
422 aa  87  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
637 aa  86.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
481 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>