131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2071 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  362  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  50.98 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  50.91 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 132 aa  50.8  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  49.09 
 
 		 264 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  34.74 
 
 		 297 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  47.27 
 
 		 269 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 248 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 253 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 132 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 132 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 241 aa  48.1  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 279 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 282 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 279 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  36.23 
 
 		 264 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2139  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  34.48 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 132 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 297 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 288 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 288 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2128  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 138 aa  45.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1709  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 229 aa  44.7  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 272 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 272 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  44.3  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 251 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 272 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 285 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  34.33 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 261 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  35.71 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 242 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0189  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 251 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528069  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  35.71 
 
 		 256 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5579  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  37.88 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 258 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  26.55 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 249 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 265 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 293 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 129 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3173  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 135 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3157  MerR family regulatory protein  37.29 
 
 		 135 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3067  MerR family regulatory protein  37.29 
 
 		 135 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  32.86 
 
 		 136 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 243 aa  42  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3096  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>