81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5352 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5352  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  56.34 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  43.37 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  44 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  48.39 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  50.72 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  47.14 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  38.03 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  40.86 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  47.22 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  36.23 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  41.03 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  43.21 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  44.29 
 
 		 85 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  44.29 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  42.86 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  41.43 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  45.95 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  47.22 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  38.03 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  45.83 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  24.05 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  30.11 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  39.71 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  38.24 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  36.25 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  36.25 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  36.25 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  38.03 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  44.44 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  36.25 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  24.05 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  41.43 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  35.63 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  41.43 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  35.21 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  43.24 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  35.53 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  39.44 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  37.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  41.43 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  42.65 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  36 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  41.18 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  35.29 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  35.21 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  34.25 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  41.89 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  32.86 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  37.14 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  39.13 
 
 		 90 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  37.14 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  36.78 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  30.99 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  40.28 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  37.14 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  37.14 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  41.89 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  31.94 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  34.72 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  34.29 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  50 
 
 		 101 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>