More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3393 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  100 
 
 		 754 aa  1525    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  31.2 
 
 		 769 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  33.2 
 
 		 774 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  42.49 
 
 		 392 aa  319  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  33.55 
 
 		 784 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  34.03 
 
 		 784 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  33.55 
 
 		 784 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  34.17 
 
 		 784 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  34.17 
 
 		 784 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  34.17 
 
 		 784 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  34.17 
 
 		 784 aa  318  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  33.12 
 
 		 783 aa  317  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  30.72 
 
 		 780 aa  308  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  31.11 
 
 		 782 aa  300  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  30.82 
 
 		 794 aa  299  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  31.33 
 
 		 788 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.05 
 
 		 783 aa  297  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  28.59 
 
 		 788 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  28.79 
 
 		 784 aa  276  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  38.06 
 
 		 391 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  44.76 
 
 		 322 aa  261  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  30.5 
 
 		 775 aa  257  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  36.55 
 
 		 409 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  44.34 
 
 		 316 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  43.71 
 
 		 316 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  44.34 
 
 		 316 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  43.08 
 
 		 316 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3613  cytochrome P450  34.06 
 
 		 410 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235331  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  46.88 
 
 		 319 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  46.08 
 
 		 317 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2077  cytochrome P450  34.26 
 
 		 412 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  42.3 
 
 		 319 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  45.6 
 
 		 324 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  44.2 
 
 		 317 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3269  cytochrome P450  35.79 
 
 		 410 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  41.61 
 
 		 318 aa  228  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.61 
 
 		 316 aa  227  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  44.83 
 
 		 319 aa  227  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  45.63 
 
 		 317 aa  227  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.19 
 
 		 316 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  43.13 
 
 		 321 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  45.73 
 
 		 321 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  45.73 
 
 		 321 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  45.24 
 
 		 321 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  42.58 
 
 		 322 aa  224  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  41.9 
 
 		 323 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.63 
 
 		 315 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  34.88 
 
 		 389 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  44.37 
 
 		 321 aa  220  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  42.22 
 
 		 325 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  32.23 
 
 		 405 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  32.74 
 
 		 399 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  40.73 
 
 		 334 aa  218  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  39.64 
 
 		 326 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  42.72 
 
 		 321 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.55 
 
 		 318 aa  217  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  41.16 
 
 		 316 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  41.1 
 
 		 322 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  41.16 
 
 		 316 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  42.16 
 
 		 323 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  42.49 
 
 		 332 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  40.13 
 
 		 317 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  41.8 
 
 		 320 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  44.03 
 
 		 322 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  40.99 
 
 		 319 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.94 
 
 		 331 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  41.43 
 
 		 331 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  39.68 
 
 		 320 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  40.18 
 
 		 320 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  41.16 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  41.25 
 
 		 333 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  40.18 
 
 		 320 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  41.25 
 
 		 333 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  41.12 
 
 		 368 aa  205  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  41.12 
 
 		 368 aa  205  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  43.24 
 
 		 322 aa  205  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  41.12 
 
 		 368 aa  205  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  39.44 
 
 		 322 aa  204  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  42.19 
 
 		 324 aa  204  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  41.98 
 
 		 318 aa  204  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  42.32 
 
 		 320 aa  203  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  38.51 
 
 		 320 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  43.34 
 
 		 321 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  39.81 
 
 		 320 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  41.61 
 
 		 327 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.69 
 
 		 315 aa  202  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  41.44 
 
 		 322 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  40.19 
 
 		 321 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  38.97 
 
 		 344 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  42.47 
 
 		 321 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  36.92 
 
 		 1069 aa  197  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  37.88 
 
 		 351 aa  197  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  45.15 
 
 		 317 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.3 
 
 		 322 aa  196  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  41.31 
 
 		 330 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  41.67 
 
 		 325 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  39.29 
 
 		 316 aa  193  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  40.13 
 
 		 333 aa  193  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  40.06 
 
 		 323 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  38.05 
 
 		 321 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>