More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1145 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 507 aa  1002    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.57 
 
 		 509 aa  544  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1852  multidrug resistance transmembrane protein  51.5 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3117  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.69 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1022  multidrug resistance protein VceB  45.19 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.74 
 
 		 544 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.49 
 
 		 519 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.29 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.28 
 
 		 520 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.29 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.29 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.29 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.49 
 
 		 519 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.29 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.03 
 
 		 519 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.49 
 
 		 519 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.63 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.83 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  41.9 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.23 
 
 		 533 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.29 
 
 		 519 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.9 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.86 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.09 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.29 
 
 		 519 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43 
 
 		 518 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.43 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.83 
 
 		 527 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.84 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 		 537 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.04 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.04 
 
 		 520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.04 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.03 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.86 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.23 
 
 		 520 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.65 
 
 		 522 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.65 
 
 		 520 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.84 
 
 		 520 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.84 
 
 		 520 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.64 
 
 		 520 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.28 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  42.35 
 
 		 519 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.64 
 
 		 520 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.64 
 
 		 520 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.03 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.08 
 
 		 521 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.32 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.33 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4220  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.2 
 
 		 510 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.74 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.12 
 
 		 522 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.86 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.14 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.31 
 
 		 522 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.97 
 
 		 520 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  41.86 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.68 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  41.86 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.18 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.53 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.47 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.09 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.33 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 		 518 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.27 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.67 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.96 
 
 		 531 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  40.96 
 
 		 512 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.33 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  40.96 
 
 		 512 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.93 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  40.96 
 
 		 512 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.28 
 
 		 494 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.49 
 
 		 543 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5791  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.04 
 
 		 517 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0859755  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  40.76 
 
 		 512 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 515 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  40.32 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.32 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.8 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.32 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  40.32 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.37 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  40.32 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.72 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.2 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.2 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  40.32 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  40.32 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.8 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  42.86 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 		 515 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  43.06 
 
 		 509 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000279343  decreased coverage  0.00567017 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  40.32 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  40 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  40 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  40 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
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