More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28470 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  100 
 
 
270 aa  531  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  72.97 
 
 
273 aa  377  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  70.16 
 
 
291 aa  353  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  67.83 
 
 
280 aa  350  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  66.17 
 
 
278 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  69.38 
 
 
303 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  70.16 
 
 
287 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  68.36 
 
 
278 aa  347  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  67.84 
 
 
290 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  67.84 
 
 
290 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  67.84 
 
 
290 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  66.27 
 
 
264 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  64.42 
 
 
286 aa  330  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  66.02 
 
 
266 aa  328  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  65.49 
 
 
261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  64.37 
 
 
284 aa  326  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  61.81 
 
 
270 aa  325  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  63.81 
 
 
264 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  65.4 
 
 
277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  62.75 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  64.71 
 
 
273 aa  319  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  64.45 
 
 
271 aa  316  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  62.64 
 
 
286 aa  314  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  61.34 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  63.92 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  62.89 
 
 
264 aa  311  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  63.36 
 
 
268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  63.86 
 
 
276 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  62.2 
 
 
265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  61.09 
 
 
261 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  61.09 
 
 
261 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  61.57 
 
 
261 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  60.94 
 
 
262 aa  295  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  59.92 
 
 
263 aa  295  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  55.6 
 
 
274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  55.47 
 
 
306 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
271 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  43.97 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  47.67 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  47.67 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  47.67 
 
 
259 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  41.02 
 
 
275 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  39.43 
 
 
282 aa  201  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
272 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  41.98 
 
 
264 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  41.98 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  45 
 
 
265 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
260 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  43.28 
 
 
275 aa  182  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  38.82 
 
 
260 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  38.82 
 
 
260 aa  182  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  36.76 
 
 
260 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  39.45 
 
 
280 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  44.94 
 
 
270 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 
260 aa  175  8e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  37.8 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  43.85 
 
 
264 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  36.76 
 
 
265 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  37.25 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  34.29 
 
 
272 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  30.68 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  34.98 
 
 
261 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  27.34 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  35.56 
 
 
265 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  31.4 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  36.88 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  34.63 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  27.04 
 
 
262 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 
263 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  37.07 
 
 
636 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  25.2 
 
 
262 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.98 
 
 
269 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  24.91 
 
 
268 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  33.86 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  38.15 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  30.3 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  29.32 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  25.1 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  28.9 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  27.76 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  28.63 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  31.12 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  31.25 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  28.44 
 
 
494 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.03 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
263 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  27.23 
 
 
500 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1055  ATPase  34.76 
 
 
514 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  31.19 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  35.04 
 
 
384 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1295  putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF  33.94 
 
 
490 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0162  ABC transporter related  29.65 
 
 
499 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137929  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  30.23 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2046  ABC transporter related  27.93 
 
 
491 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.8 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  33.47 
 
 
268 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3847  ABC transporter related  28.7 
 
 
475 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000065079 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  34.72 
 
 
255 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>