More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
395 aa  803    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  68.61 
 
 
394 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  68.59 
 
 
397 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  62.95 
 
 
388 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  62.95 
 
 
394 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2560  acetyl-CoA acetyltransferase  54.43 
 
 
389 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.800348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
389 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6598  acetyl-CoA acetyltransferase  55.09 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611085  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 
389 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  53.79 
 
 
388 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  53.93 
 
 
389 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  53.79 
 
 
395 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  54.29 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  53.93 
 
 
389 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 
389 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  52.88 
 
 
389 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  51.96 
 
 
389 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  51.43 
 
 
389 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  52.62 
 
 
392 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5670  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
389 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  52.22 
 
 
388 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  52.36 
 
 
388 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
460 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  50.79 
 
 
386 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
390 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  51.17 
 
 
386 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
389 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1439  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 
389 aa  362  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  decreased coverage  0.000000285125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  52.73 
 
 
388 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
392 aa  358  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.49 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  38.48 
 
 
394 aa  236  6e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 
390 aa  235  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  37.63 
 
 
388 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.56 
 
 
392 aa  230  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  36.5 
 
 
388 aa  229  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.05 
 
 
392 aa  229  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  38.13 
 
 
390 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  37.56 
 
 
388 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  37.3 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  38.66 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  36.9 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.36 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  37.76 
 
 
387 aa  210  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.81 
 
 
383 aa  211  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  38.52 
 
 
388 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  37.79 
 
 
388 aa  209  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  37.17 
 
 
387 aa  207  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.49 
 
 
387 aa  206  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.53 
 
 
389 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.03 
 
 
397 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.2 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.79 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 
395 aa  200  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.53 
 
 
384 aa  200  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  35.48 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  35.28 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  36.27 
 
 
390 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.08 
 
 
387 aa  195  9e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  34.18 
 
 
391 aa  195  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.15 
 
 
388 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  33.76 
 
 
388 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  35.61 
 
 
400 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  37.5 
 
 
386 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  36.15 
 
 
388 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  34.96 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.25 
 
 
394 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  35.95 
 
 
386 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.41 
 
 
376 aa  183  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  35.1 
 
 
387 aa  182  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 
398 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  33.82 
 
 
398 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  35.4 
 
 
400 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  35.33 
 
 
392 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  30.79 
 
 
404 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  33.73 
 
 
401 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  35.33 
 
 
392 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.88 
 
 
378 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1808  acetyl-CoA acetyltransferase  36.81 
 
 
406 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286028  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0900  acetyl-CoA acetyltransferase  35.19 
 
 
407 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  35.33 
 
 
392 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  36.07 
 
 
383 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10932  acetyl-CoA acetyltransferase  36.47 
 
 
412 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1546  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  39.23 
 
 
401 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.7 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.78 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4939  acetyl-CoA acetyltransferase  32.99 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.01223 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  34.76 
 
 
392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  32.43 
 
 
413 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.37 
 
 
378 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  31 
 
 
407 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  35.88 
 
 
387 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  38.82 
 
 
387 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  31.84 
 
 
412 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1270  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 
406 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143492  hitchhiker  0.00783632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.44 
 
 
413 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  31.44 
 
 
413 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  31.44 
 
 
413 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  31.93 
 
 
413 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  34.84 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>