More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  100 
 
 
130 aa  264  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  58.33 
 
 
115 aa  138  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  63.06 
 
 
120 aa  136  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  55.86 
 
 
115 aa  133  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  54.21 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  59.43 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  54.46 
 
 
120 aa  127  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  59.26 
 
 
116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7052  histidine triad (HIT) protein  58.56 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  54.95 
 
 
118 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  54.21 
 
 
118 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 
113 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 
113 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0817  histidine triad (HIT) protein  47.54 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00411687  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  63.89 
 
 
117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 
116 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  54.21 
 
 
116 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1155  histidine triad (HIT) protein  62.04 
 
 
114 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  58.41 
 
 
119 aa  116  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  52.83 
 
 
114 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1909  histidine triad (HIT) protein  56.6 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1824  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
118 aa  114  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000876715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2189  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 
119 aa  114  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  54.46 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
115 aa  114  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50.93 
 
 
115 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1696  purine nucleoside phosphoramidase  45.54 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1588  purine nucleoside phosphoramidase  45.54 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.029862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2814  purine nucleoside phosphoramidase  45.54 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13460  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  48.33 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216687 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1731  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.193386  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  51.4 
 
 
112 aa  110  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2755  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.431838  normal  0.0942813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0390  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 
113 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  55.14 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1522  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0860  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17260  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  49.58 
 
 
124 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1487  histidine triad family protein  43.64 
 
 
116 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.194182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  49.11 
 
 
131 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1920  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000438261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2492  purine nucleoside phosphoramidase  45.45 
 
 
116 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.244551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
114 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2798  purine nucleoside phosphoramidase  45.45 
 
 
116 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01099  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.557405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2544  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00193524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  45.79 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01107  hypothetical protein  49.09 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2023  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11289  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1226  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0205658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2498  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.809063  hitchhiker  0.000000239034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1225  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000303033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1483  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  hitchhiker  0.0000582139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2220  purine nucleoside phosphoramidase  49.09 
 
 
119 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0273576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1834  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
118 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250405  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  48.08 
 
 
113 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2488  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
118 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461779  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1790  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
118 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.305934  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1798  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
118 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1602  purine nucleoside phosphoramidase  48.18 
 
 
116 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1448  HIT family protein  45.45 
 
 
117 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00741  HIT (histidine triad) family protein  49.06 
 
 
113 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.39075  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2723  HIT family protein  44.55 
 
 
118 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  46.23 
 
 
113 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 
128 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  43.97 
 
 
127 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1654  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
118 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0399957  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2325  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
117 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1134  HIT-like protein  45.37 
 
 
116 aa  106  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.26746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2314  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
118 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.409498  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2384  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
118 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  44.95 
 
 
123 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2507  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
118 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 
114 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1295  HIT family protein  42.73 
 
 
116 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  44.74 
 
 
126 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1633  purine nucleoside phosphoramidase  46.36 
 
 
116 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00090924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
116 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1304  purine nucleoside phosphoramidase  48.18 
 
 
125 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  hitchhiker  0.00000000733928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2164  purine nucleoside phosphoramidase  48.18 
 
 
125 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000113916 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  44.86 
 
 
117 aa  105  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
115 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
126 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1319  purine nucleoside phosphoramidase  48.18 
 
 
125 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.862019  hitchhiker  0.00000332537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0179  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
170 aa  104  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1281  purine nucleoside phosphoramidase  48.18 
 
 
125 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.293416  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
112 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
112 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
112 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1980  purine nucleoside phosphoramidase  48.18 
 
 
119 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.40336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 
114 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
114 aa  103  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1883  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
118 aa  103  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  normal  0.179498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>