293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  100 
 
 
451 aa  889    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  57.02 
 
 
510 aa  478  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.85 
 
 
493 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  51.98 
 
 
493 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  47.95 
 
 
548 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  44.47 
 
 
492 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.05 
 
 
486 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3014  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.86 
 
 
501 aa  360  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.264666  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  47.84 
 
 
493 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  48.63 
 
 
496 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  47.49 
 
 
464 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  47.81 
 
 
455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  44.9 
 
 
489 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  43.74 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  43.39 
 
 
488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.09 
 
 
493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.17 
 
 
488 aa  335  7e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  43.17 
 
 
488 aa  335  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  43.17 
 
 
488 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.17 
 
 
488 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  43.17 
 
 
488 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  42.43 
 
 
490 aa  335  9e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  40.66 
 
 
497 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.8 
 
 
497 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  44.77 
 
 
498 aa  333  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.18 
 
 
505 aa  330  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.7 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  46.58 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  42.2 
 
 
490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  42.2 
 
 
490 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  42.2 
 
 
490 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  43.64 
 
 
488 aa  326  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  42.06 
 
 
490 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  42 
 
 
495 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.06 
 
 
490 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  41.98 
 
 
490 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  41.98 
 
 
490 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  43.98 
 
 
490 aa  323  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.22 
 
 
497 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  41.76 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  41.76 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  42 
 
 
495 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  41.76 
 
 
486 aa  319  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  38.76 
 
 
487 aa  319  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  41.09 
 
 
486 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.09 
 
 
486 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  41.09 
 
 
486 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  41.76 
 
 
486 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.54 
 
 
486 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  40.87 
 
 
486 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  40.87 
 
 
486 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  44.26 
 
 
485 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  40.87 
 
 
486 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  40.87 
 
 
486 aa  317  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  40.87 
 
 
486 aa  316  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.85 
 
 
509 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.1 
 
 
486 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  41.1 
 
 
486 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.3 
 
 
528 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.4 
 
 
488 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  41.1 
 
 
486 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  41.1 
 
 
486 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.07 
 
 
493 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.5 
 
 
485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  43.34 
 
 
478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.6 
 
 
490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.84 
 
 
460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.84 
 
 
460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  45.81 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  43.83 
 
 
492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  45.77 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  42.35 
 
 
487 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  41.87 
 
 
488 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.2 
 
 
499 aa  299  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  41.87 
 
 
488 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.67 
 
 
490 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  41.87 
 
 
488 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  41.87 
 
 
488 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  40 
 
 
488 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  43.22 
 
 
458 aa  297  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  41.65 
 
 
488 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  44.96 
 
 
484 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  45.14 
 
 
498 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  45.14 
 
 
489 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  45.14 
 
 
489 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  44.91 
 
 
489 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  44.91 
 
 
489 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  44.91 
 
 
489 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  44.91 
 
 
489 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  41.16 
 
 
491 aa  293  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  38.99 
 
 
484 aa  292  9e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.4 
 
 
485 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  40.82 
 
 
470 aa  290  3e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  45.83 
 
 
485 aa  289  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.11 
 
 
487 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.18 
 
 
494 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  41.91 
 
 
452 aa  286  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  41.31 
 
 
503 aa  285  9e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4288  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.59 
 
 
499 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.760127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>