More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 379 aa  740    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  45.24 
 
 		 411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  37.82 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.02 
 
 		 404 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  40.5 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  40.5 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  39.94 
 
 		 409 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 		 437 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  36.53 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.42 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  28.61 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  28.36 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  32.65 
 
 		 440 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  30.5 
 
 		 431 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.25 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  29.89 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  32.87 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.85 
 
 		 377 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.42 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.82 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.14 
 
 		 362 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.14 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.94 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.75 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.38 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.33 
 
 		 351 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.38 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.38 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.67 
 
 		 362 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.41 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  27.5 
 
 		 437 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  46.15 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  34.82 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.88 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.8 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.78 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.96 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.39 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.6 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.11 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  32.11 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.62 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.05 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.6 
 
 		 350 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.33 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.82 
 
 		 351 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.83 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  31.83 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.43 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.8 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.83 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  28.4 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.2 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.33 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  35.04 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  31.06 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  36.93 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  38.96 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.33 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.25 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.95 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  41.87 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  32.21 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.17 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.3 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.3 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  32.33 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.09 
 
 		 374 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  40 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.9 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.27 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.19 
 
 		 876 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.91 
 
 		 360 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.41 
 
 		 359 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.42 
 
 		 422 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  32.88 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.61 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.76 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.52 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.03 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.71 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.04 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.5 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.6 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.06 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.43 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.53 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.08 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.53 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.53 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.53 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.53 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.53 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.53 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>