More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0964 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0969  response regulator receiver domain-containing protein  40.44 
 
 		 328 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  30.6 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  30.54 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 229 aa  102  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  30.6 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  28.32 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  29.87 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  28.83 
 
 		 231 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.04 
 
 		 229 aa  97.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  30.22 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0987  response regulator receiver domain-containing protein  35.46 
 
 		 420 aa  96.3  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  29.73 
 
 		 224 aa  95.5  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  29 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  27.68 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.47 
 
 		 425 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0984  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  33.82 
 
 		 564 aa  90.5  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  26.5 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  37.21 
 
 		 566 aa  89  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1041  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 365 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  27.39 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0968  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.730939  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0432  putative two-component regulator  30.7 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  26.11 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  26.22 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  25.78 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  25.22 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32 
 
 		 616 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  25.22 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  29.82 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.22 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  24.9 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.78 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  26.41 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  28.19 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  27.56 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.44 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  25.66 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  24 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  32.29 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  28.32 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1058  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000718409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.23 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  25.45 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  27.66 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  26.42 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0009  two component transcriptional regulator  32.22 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.33 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1597  two component transcriptional regulator  23.89 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.15 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.07 
 
 		 953 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.78 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.78 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.15 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.55 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0208  response regulator receiver domain-containing protein  38.18 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  26.61 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.78 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  27.83 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  27.66 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.37 
 
 		 953 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.15 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  26.15 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4983  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.56 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  26.2 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  34.09 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  23.89 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  26.81 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  23.89 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3454  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.64 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  28.57 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  26.55 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  26.92 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  24.66 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  24.86 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  24.86 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  24.86 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.46 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  24.23 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  25.25 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  25.33 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1132  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  27.43 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  24.32 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  22.57 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  25.88 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  25.33 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>