192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0802 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0802  DnaB-like helicase-like  100 
 
 		 557 aa  1135    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.507024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0957  DnaB-like helicase-like  47.66 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1595  replicative DNA helicase  28.51 
 
 		 476 aa  103  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0375  replicative DNA helicase  29.91 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0261  hypothetical protein  26.73 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0982  replicative DNA helicase  29.07 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0681  replicative DNA helicase  31.82 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1223  replicative DNA helicase  29.72 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0995  replicative DNA helicase  28.57 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.923932  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0667  replicative DNA helicase  26.72 
 
 		 458 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0587  replicative DNA helicase  26.72 
 
 		 458 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.198545  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1371  replicative DNA helicase  26.29 
 
 		 460 aa  67  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  26.43 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1360  replicative DNA helicase  25.18 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  24.27 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  25.16 
 
 		 476 aa  62  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  26.46 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  25.48 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  24.88 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  25.16 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  25.16 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  25.81 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  26.19 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  24.07 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  22.31 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  24.19 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  23.67 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  26.07 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  26.05 
 
 		 450 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  26.07 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  25.94 
 
 		 458 aa  57  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  24.82 
 
 		 444 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  25.12 
 
 		 865 aa  57  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  23.47 
 
 		 1272 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3492  DnaB domain protein helicase domain protein  31.48 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1720  replicative DNA helicase  23.58 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  34.55 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1347  replicative DNA helicase  24.03 
 
 		 458 aa  55.5  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  24.64 
 
 		 824 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  21.86 
 
 		 442 aa  54.7  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  25.73 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  21.6 
 
 		 457 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  25.24 
 
 		 451 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11520  primary replicative DNA helicase  24.77 
 
 		 473 aa  53.9  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.213802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  23.4 
 
 		 453 aa  53.5  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  24.11 
 
 		 939 aa  53.5  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  31.82 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  24.78 
 
 		 610 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  25.76 
 
 		 602 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  23.87 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  26.14 
 
 		 508 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  24.44 
 
 		 451 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2624  replicative DNA helicase  24.62 
 
 		 472 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  28.32 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0336  DNA repair protein RadA  24.7 
 
 		 466 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  28.83 
 
 		 472 aa  51.2  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  24.35 
 
 		 610 aa  51.2  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3371  DnaB family helicase  22.3 
 
 		 455 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  21.98 
 
 		 449 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  22.43 
 
 		 871 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  21.74 
 
 		 481 aa  50.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  25.47 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  23.56 
 
 		 450 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 1381 aa  50.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  20.15 
 
 		 772 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  25.64 
 
 		 590 aa  50.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  22.94 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  23.94 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  22.97 
 
 		 468 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3747  replicative DNA helicase  22.42 
 
 		 453 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  20.76 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  21.34 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  20.43 
 
 		 509 aa  48.9  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  23.43 
 
 		 461 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  25.37 
 
 		 456 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  23.9 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0343  ATPase-like protein  25.27 
 
 		 679 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0321483  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0607  replicative DNA helicase  21.09 
 
 		 453 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  40.74 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  20.37 
 
 		 844 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2542  replication protein A  23.05 
 
 		 292 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000605873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  25 
 
 		 1098 aa  48.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  40.74 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2110  DNA repair protein RadA  23.53 
 
 		 452 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3564  hypothetical protein  25.14 
 
 		 734 aa  47.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  22.69 
 
 		 874 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0136  DNA repair protein RadA  26.46 
 
 		 456 aa  47.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  23.66 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  21.98 
 
 		 462 aa  47.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  21.95 
 
 		 464 aa  47.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  21.88 
 
 		 832 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  23.66 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  23.27 
 
 		 489 aa  47.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  25.35 
 
 		 456 aa  47.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4407  replicative DNA helicase  22.79 
 
 		 440 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  19.73 
 
 		 458 aa  47.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1459  replicative DNA helicase  21.83 
 
 		 467 aa  47.4  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1462  primary replicative DNA helicase  38.89 
 
 		 2605 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.695864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  21.23 
 
 		 903 aa  47  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  37.29 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>